颜色：对任何宝石来说，颜色都是非常重要的，水晶也不例外。如果是水晶晶体是有颜色的，如粉水晶、黄水晶、紫水晶等，其颜色评价的最高标准则是明艳动人，不带有灰色、黑色、褐色等其他色调。如粉水晶，颜色以粉红为佳；紫水晶，要求颜色为鲜紫，纯净不发黑；黄水晶，要求颜色不含绿色、柠檬色调，以金橘色为佳。对于发晶来说，晶体的颜色也是很重要的。相同发丝的金发晶，晶体完全无色（白水晶）和晶体略偏茶色，肉眼的视觉观感也是有差别的，所以前者的价格会高于后者。须知，水晶的晶体颜色越清浅明亮，被你的肉眼看到的闪亮的发丝状内含物就能越美丽，所以，购买发晶和幽灵水晶，以晶体通透无色为佳。
净度：水晶与高档宝石的净度要求有很大不同。高档宝石稀少罕见，所以一般人们普遍对高档宝石的净度不会过于苛求。而水晶的产量着实大得惊人，所以通常人们会要求水晶净度越高越好，尽量避免有较明显的内含物的水晶。
水晶常见的内含物有棉絮状包裹体（水晶行业俗称“棉”）、裂痕、平行色带、各种伴生矿物等等，如紫水晶和粉水晶，常见有棉絮状包裹体，如果能够颜色美艳且晶体纯洁，就是非常不错的选择。不过对于金发晶、银发晶和幽灵水晶来说，内含物才是水晶的观赏价值所在，所以它们相对来说，其内含物不仅不是缺点，反而成了优点和卖点。 因此除了颜色，水晶的净度和内含物对其价值影响也很大。以发晶举例：发丝的颜色也至关重要，如果是金发晶，要求发丝金黄璀璨，接近黄金的颜色，偏向太淡的黄色或褐红就不够悦目；绿发晶则要求颜色尽量鲜明翠绿，不要偏向发黑的深墨绿色；银发晶则要求银丝明亮。同理，幽灵水晶也要求幽灵（绿泥石）和晶体的分布以和谐为佳，一般来说，水晶的内含物（特指发丝、幽灵、红黄云母和兔毛）太稀疏会显得淡薄，内含物满布则无法表现出晶体的通透晶莹，因此要以内含物较多而不满布为最佳，这种相得益彰的效果最受到市场的欢迎。另外在宝石行业内，人们对一些具有产生画面般美感的水晶通称为“景石”，这些特别的水晶因内部奇巧的画面或诗意的景色而深受消费者的喜爱，价格也会较普通水晶会贵一些。