1.0石器时代 2000年04月20日台湾石器1.0版问世，陶莉萍担任代言人。最高等级上限:120无家族系统无骑乘宠物系统中途增加交易系统中途增加包月系统中途由1分钟0.10点数变成为1分钟0.12点数(包月300点变成为360点) 。2.0家族开拓史 2001年08月01日台湾石器更新到2.0版本。最高等级上限:140增加AI(自动战斗)系统，可往返飞行于各岛之间。增加家族系统增加骑宠系统增加精灵王的传说—转生系统2.5精灵王传说 2001年11月25日台湾石器更新到2.5版本。 2002年02月05日大陆石器更新到2.5版本。增加宠物转生系统开放新地图—天空之岛增加攻击性魔法新增任务3.0伊甸新大陆 2002年01月25日台湾石器更新到3.0版本 2002年04月20日大陆石器更新到3.0版本新增五大城市(地城, 水城, 火城, 风城, 伊甸)开放宠物新技能4.0新九大家族 2002年07月15日台湾石器更新到4.0版本。 2002年09月13日大陆石器更新到4.0版本。新增五大庄园增加了10种新骑宠新增可爱的表情全新的魔族任务增加新技能增加新素材、装备5.0宠物进化史 2002年11月台湾石器更新到5.0版本，许慧欣担任代言人。 2003年01月20日大陆石器更新到5.0版本。新增宠物融合系统6.0海贼王遗迹 2003年1月27日台湾石器更新到6.0版本。 2003年6月10日大陆石器服务器：中国网通9、四川电信1、四川电信2和北京中华网率先进行版本升级，随后其他服务器也更新到6.0版本。新增海底地图新增道具:鱼鳃草, 海底呼吸用新增海底任务新增海底宠物
7.0石头就业所 2003年12月15日日大陆石器服务器更新到7.0版本。新增职业系统: 白狼勇士, 追猎者, 闇灵法师新增密语系统新增装备系统: 手套, 左手, 鞋子, 腰包新增英雄战场(一共132楼, 可获得流星手套: 攻+25防+50敏+20)7.5精灵的召唤 2004年9月15日大陆服务器更新。新增职业技能宠物二转人物六转新地图8.0失落的世界 2005年6月8日台湾石器更新到8.0版本。 大陆金山软件代理运营的石器时代，自8.0之后的版本与之前的版本区别开来，重新定名为新石器时代。新增宠物装备系统新增导师系统新增任务日志新增冰城地图新增冰城宠物新增回炉系统新增签到系统新增海底宠物融合系统(类似5.0)
8.5魔域大冒险新增全新冒险地图：一个神秘的地域，没人知道魔域所存在的地方，借由魔界之门通往充满火山烟雾与毫无生气的世界，新增大小十几张地图等你前往冒险。新增新增全新系统
魔军讨伐奖励系统：玩家可以借由击杀魔界将领取得身上物品才可换取讨伐积分，同样的该积分因阵营的不同，而可以换取不同的奖励。每日常驻活动系统：借由提供魔域前线勇士物资而提供每日任务让玩家参与，可以获得许多道具。
《石器时代》的故事都发生在一个叫做“尼斯大陆”的大地上。尼斯大陆原本是一个完整的陆块，但是在火山爆发之后，强大的自然力量将大陆分成了“吉鲁岛”，“萨伊纳斯（北岛）”和“加鲁卡（南岛）”三个岛屿，而游戏的世界主要是由风格迥异的“萨伊纳斯”和“加鲁迦”两大岛组成的。“萨伊纳斯”岛位于尼斯大陆的东侧出海口附近，气候温和宜人，适合居住。岛上的“玛丽娜斯村”和“萨姆吉尔村”是玩家可选择的两个出生地，“萨姆吉尔村”以英雄萨姆基鲁为名，村中有座巨大的英雄雕像，游戏内统称萨姆吉尔；“玛丽娜斯村”则是以海产著名的村落，村民相当温和可亲，而所谓的“玛丽娜斯”指的就是“海的精灵”，游戏内统称渔村。
“加鲁卡”是一座被大量森林覆盖的热带岛屿，是充满了原始野性风味的冒险天堂。它有大自然的渥眷恩赐，拥有遍地绿野，如果说其他地方都是“石”的文化，那么此地就是属于“木”的文明了。这里还有许多可供探险的特殊地点和种类繁多的生物，其中还有一个可爱的“小矮人”村落等着玩家发现呢！在这里玩家可以选择两个出生地，其中之一的“加加村”是一座建筑在树上的村落，而另外一个“卡鲁它那”则是由数十个小岛组成的渔村。