在下水道塞西尔和凡恩互相介绍，对话后前往凡恩的“宫殿”，这里有个很体贴的设定就是在每个迷宫中都有提示牌，显示本地图怪物的等级，冒险前最好仔细看看，等级相差太大就返回上一地图练级一下，有红色感叹号的宝箱会出现比较珍贵的物品，别错过。
走到机关前面凡恩进行讲解，这时按9键切换凡恩为领队调查机关就可以开启铁门了，进去有一场Boss战，魔化老鼠会使用吸血和召唤，不过攻击力很低，打败魔化老鼠爆出初级生命宝石，镶嵌系统开启，宝石一共五种属性，分三个等级，分别对应三种等级的装备，先前打怪爆出的各种颜色碎片可以合成不同属性的宝石。 剧情后爬上楼梯来到郊外，两人因为追逐蝴蝶在森林深处发现一块龙晶石，塞西尔听见有人在呼唤自己，凡恩却想把石头拿来卖钱，序章结束。
场景切换到塞西尔家，凡恩将龙晶石藏在塞西尔房间，两人出门去黑市，来到北部商业区和黑色天平标志的屋子门口的洛克对话接到后续任务送信，凡恩离队，塞西尔出城来到塔法尼亚平原和凡恩汇合，在图中位置找到独眼大汉。
交出信得到密码206，再返回黑市把密码告诉洛克，对话后返回家里拿龙晶石，不知情的塞西尔父亲因为私藏龙晶石被判发配人间牧场进行奴役改造，塞西尔被当成共犯逮捕关押在水牢监狱，遇到古代人埃姆雷，一段剧情后塞西尔脖子上的十字伤疤似乎隐藏着什么秘密，这时黑市的洛克和凡恩来劫狱，四人逃亡遭遇强敌典狱长，打赢后沿路走触发三巨头之一的阿比莉丝拦路剧情，战斗的胜利并不能挽救埃姆雷的性命，临终前埃姆雷让塞西尔到香巴拉寻找真相，混乱中三人失散。
从监狱逃出来的塞西尔决定去人间牧场找父亲，在路上遇到宿命的伙伴妮丝，前期防御较低注意用塞西尔的圣盾术保护，妮丝的变蛙术能有效的控制战场，在克洛洛村庄休息了一夜，两人出发来到密道，让妮丝领队可以烧掉挡路野草，密道里的黑暗怪物都是会吟唱魔法的，记得多带闪光瓶，可以打断吟唱使战斗更轻松。 穿过密道进入人间牧场，到这里多了一种推石头的机关，用塞西尔领队即可，一路来到牧场深处，发现士兵正在用活人做实验，而塞西尔的父亲被成功改造成栽培体，击杀一批卫兵后再次遭遇阿比莉丝，父亲为了救塞西尔惨遭毒手，逃出牧场的塞西尔得知妮丝是拉斯维尔人。
这时凡恩重新加入队伍，三人趁守卫忙于龙晶石的事情返回克洛洛村，妮丝讲述龙晶石的故事，另一方面阿比莉丝奉命前往克洛洛村追杀妮丝等人。
出村子往东来到矮岭之丘，本地图的怪物会使用闪光技打断吟唱魔法，因此妮丝就有点派不上用场，穿过矮岭平原便是贤者村庄，帮忙收拾了乌鸦三兄弟后从爱德华口中得知了香巴拉的线索，在去海兰王国前三人决定返回克洛洛村一趟，只是村子已经被阿比莉丝毁掉了，三人踏上海兰王国的旅程。 在海兰通道的贫民窟妮丝离开队伍，对话后来到欧巴的家门前再次收拾乌鸦三兄弟从欧巴的水晶球里得知了自己的宿命，然后传来妮丝被捕的消息，凡恩只身前往调查，穿过贫民窟密道潜入塔法尼亚，守卫森严凡恩只好去克洛水果店，调查柜子发现暗道。
场景切换到海兰通道，对话后往东进入海兰沙漠，这里的怪物有坚硬外壳，使用物理攻击会受到反弹，一进沙漠就遭遇蜥蜴人的袭击，一路来到海兰墓地，发现一名少女。
这时少女蕾莉亚出现危险，被三人解救，剧情后继续向东来到海兰遗迹，从沙漠中翻出一本枯黄的书，得到线索寻找守护月亮石的人，然后救下一名海兰居民，对话后场景切换到海兰沙漠尽头，穿过绿洲来到王之盾巴尔家。 击败巴尔出现一段破魔石的剧情，这时巴尔的府邸倒塌，妮丝下落不明，走到地图中的闪光出发现妮丝的项链，蕾莉亚加入队伍，对话后出发寻找月亮石。
用蕾莉亚领队轻松破除迷幻森林的陷阱来到入口接受智慧之树的考验，打败四只蝙蝠枯树即可，在精灵居所面见精灵之王了解香巴拉的故事，对话后竞技场开启，在竞技场中可以获得高级甚至极品装备，现在前往精灵神殿，翡翠巨龙将三人传入各自梦境，只有凡恩通过考验并拯救了塞西尔和蕾莉亚，剧情后得到月亮之核，通过精灵之王的咒语得知支配权仗在北方之城，这时候精灵叛徒斯摩尔来抢月亮之核，击败他三人动身前往北方之城找大贤者沃德。 来到北方之城，和头上有红色感叹号的人对话触发剧情，接着来到北方之城2右上角的房子得知大贤者在东面的山洞，来到山洞发现斯摩尔打败沃德夺取了权仗，三人性命堪忧，这时候失踪的妮丝突然出现并拿出第三件神器心红血钻，终于打败了斯摩尔，但支配权仗却被阿比莉丝拿走了。
重伤的妮丝被三人送到精灵之王住处，第二天妮丝和蕾莉亚两人对战真正的叛徒洛克，战斗可能会有点悬，战前尽量强化两位女队友，之后凡恩被阿比莉丝的支配权仗控制和三人发生战斗，之后为了救塞西尔，魔化凡恩死亡。
对话后被传送到塔法尼亚皇宫，进行最终大决战，为漫长的旅途画下句号。