首先要明确进行股权转让需要缴纳印花税和个人所得税。印花税是根据交易额按一定比例缴纳的；而个人所得税平价转让原则上是不收取的，但是国税函〔2009〕285号文件第四条第二款规定，对申报的计税依据明显偏低(如平价和低价转让等)且无正当理由的，主管税务机关可参照每股净资产或个人股东享有的股权比例所对应的净资产份额核定。 可以看出，恶意平价或低价转让，是涉嫌偷逃税款的。
印花税股权转让行为发生频率不高，不少纳税人尚不知道股权转让书据需要贴花。而实际上，印花税作为一种行为税，只要纳税人书立、领受《中华人民共和国印花税暂行条例》列举的应税凭证，就必须贴花。股权转让所立的书据属于印花税征税税目，即 “产权转移书据”税目中“财产所有权”，按所载金额万分之五贴花。
个人所得税不少纳税人、扣缴义务人对于股权转让环节可能涉及个人所得税纳税义务认识较为片面，以为只要自然人股东采取平价或低价形式转让股权，便没有所得，无须申报缴纳或扣缴个人所得税;甚至有的受让人不知道在向转让人(原自然人股东)支付股权转让款项时有扣缴其个人所得税的义务，从而给征纳双方增加不必要的成本、损失。现就相关政策作一梳理。
适用税目。《中华人民共和国个人所得税法》(以下简称个人所得税法)第二条第九项规定，财产转让所得应纳个人所得税。《中华人民共和国个人所得税法实施条例》(以下简称实施条例)第八条第九项规定，股权转让所得属于财产转让所得项目。应纳税所得额的计算。实施条例第二十二条规定，财产转让所得按照一次转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额，作为应纳税所得额。就股权转让所得而言，其应纳税所得额=股权转让价-股权计税成本-与股权转让相关的印花税等税费。税率个人所得税法第五条第五项规定，财产转让所得适用百分之二十的比例税率。
纳税义务人、扣缴义务人个人所得税法第八条规定，个人所得税，以所得人为纳税义务人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。对于股权转让来说，即以受让人为扣缴义务人。纳税申报实施条例第三十五条规定，扣缴义务人在向个人支付应税款项时，应当依照税法规定代扣税款，按时缴库，并专项记载备查。同时，个人所得税法第九条规定，扣缴义务人每月所扣的税款，应当在次月十五日内缴入国库，并向税务机关报送纳税申报表。主管税务机关。国税函〔2009〕285号文件第三条规定，个人股东股权转让所得个人所得税以发生股权变更企业所在地地税机关为主管税务机关。平价、低价转让的税收政策。国税函〔2009〕285号文件第四条第二款规定，对申报的计税依据明显偏低(如平价和低价转让等)且无正当理由的，主管税务机关可参照每股净资产或个人股东享有的股权比例所对应的净资产份额核定。
并不是所有的平价股权转让，税务机关都会对其进行核定。如果纳税人有正当理由进行平价股权转让，在向主管税务机关办理股权转让纳税申报时，报送计税依据明显偏低但有正当理由的证明材料，税务机关会认可其申报的股权转让计税基础。目前，我国税法针对个人股东股权转让收入明显偏低，规定了四种例外情形。《股权转让所得个人所得税管理办法（试行）》（国家税务总局公告2014年第67号）第十三条规定，符合下列条件之一的个人股权转让收入明显偏低，视为有正当理由：
一、三代以内直系亲属间转让继承或将股权转让给其能提供具有法律效力身份关系证明的配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女、兄弟姐妹以及对转让人承担直接抚养或者赡养义务的抚养人或者赡养人。证明时应提供结婚证、户籍证明、户口本或公安机关出具的其他证明资料原件及复印件，或能够证明赡养、抚养关系的民政部门出具的相关证明资料的原件及复印件。
二、部分限制性的股权转让相关法律、政府文件或企业章程规定，并有相关资料充分证明转让价格合理且真实的本企业员工持有的不能对外转让股权的内部转让。证明时应提供相关法律、政府文件或企业章程，内部转让协议等。
三、受合理的外部因素影响导致低价转让能出具有效文件，证明被投资企业因国家政策调整，生产经营受到重大影响，导致低价转让股权。证明时应提供相关政策依据，包括文件名称、文号、主要内容等。
四、股权转让双方能够提供有效证据证明其合理性的其他合理情形。
关于股权平价转让要交税吗这个问题，我国的法律规定，平价、低价转让的股权，也是需要进行缴纳税费的，另外，企业股权转让的纳税主要是有印花税以及个人所得税两种税费，其中，个人所得税的要求是比较复杂的，我们在进行纳税之前要先做好了解。
虽然税法规定了可以较低价格转让股权的几种情形，但在实际操作中肯定还会有税务机关认定不统一、执行不一致的地方。因此，交易双方在适用上述“正当理由”时，应与当地的税务机关做好沟通，以免产生不必要的纳税争议。