开源ERP：开源应用程序理论上相比专属的程序系统更为灵活，开源ERP系统也不例外。开源ERP的系统用户相对更容易地结合自身的特殊业务需求从头开始定制开发系统。除此之外，开源ERP在做系统开发时可以略去不必要的功能。对于专业ERP业务模式，供应商通常需要对现有的客户进行大幅度的追加销售，促使客户在不必要的程序上进行投资，以此来满足供应商自身长期的收益。相比之下开源ERP会更容易避免这种“功能膨胀”。
与传统的商业ERP一样，SaaS ERP也向客户提供一系列标准化流程和权限。这样可以使企业在实施过程更有条理，特别适用于那些对财务管理方面设置严格权限控制的企业。然而，SaaS ERP优于传统商业ERP的在于系统的定制开发更为容易和灵活。具体来讲该解决方案可以通过为用户提供免费的开发工具，来帮助用户根据整体业务流程从头定制开发系统。比如，NetSuite这样的系统可以为用户提供SuiteFLex这样的工具来帮助企业在系统中建立自身的业务流程，此外NetSuite还提供SuiteScript工具来帮助程序开发员进一步进行代码定制化工作。
这些工具可以使企业在发展具备竞争优势的业务流程的同时，也受益于SaaS ERP系统的标准化功能的优越性。SaaS ERP供应商的合作伙伴也可以使用同样的工具来优化现有的标准流程，进行二次开发和集成。中国的NetSuite用户可以享受在NetSuite平台之上 直接生成符合中国地方会计准则的报表，也可以体验该系统与一些流行的第三方电子商务平台的完美集成。
SaaS ERP的另外一个优势是其终端客户不需要在深技术层面去进行系统多方面的定制开发。用户可以轻而易举地自定义报表，搜索保存和仪表盘布局并可以随时随地通 过网络来访问数据。这就意味着SaaS ERP相比传统ERP或者开源ERP来说更容易进行必要的定制化流程。