（二）邀请公证机关进行公证保全。 所谓的公证取证，是指权利人邀请公证处的公证人员到现场取得证明侵权人实施发行、销售侵权物品证据的取证形式。由于公证机关具有较高的公信力，故其所保全、收集的证据，法律一般推定为真实。故权利人在起诉前，可选择以公证取证的方式更好地收集证据。
（三）通过行政机关或公安机关取证。 当权利人认为其商业秘密被侵犯，并握有初步的证据时，可向工商行政管理机关申请查处侵权行为。在应权利人请求由权利人出具自愿对强制措施后果承担责任的书面保证后，工商行政管理机关可取扣留被控侵权人的载有相关商业秘密的图纸、软件及其他有关资料，责令被控权人停止销售使用权利人商业秘密生产的产品等措施；而当权利人认为商业秘密侵权较为严重，造成的损失达50万元以上或可能造成其他严重后果构成犯罪时，向公安机关报案，当公安机关受理后，由其进行专门的侦查取证。
（四）申请法院进行诉前证据保全，或在诉讼过程中申请由法院调取和保全证据。 权利人发现侵权行为，且情况紧急不立即采取措施，证据可能灭失或以后难以取得时，可通过向法院提供担保后，申请诉前证据保全；在进行商业秘密侵权诉讼过程中，权利人对于自己无法取得的证据，也可申请由法院调查取证，从而更好的收集商业秘密被侵权的证据。
（一）证据保全的提出。 根据《民事诉讼法》、《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》的有关规定，向法院申请证据保全的申请人（可以是原告，也可以是被告）必须是案件当事人或利害关系人，申请不得迟于举证期限届满前七日，并且必须为情况紧急之时（若不立即保全，证据将灭失或以后难以取得）。同时，当事人申请保全证据，人民法院可要求其提供相应的担保。
（二）法院对当事人申请的审查。 法院对当事人的保全申请的审查，一般包括以下几方面： 1．申请人是否适格、证据保全的理由是否充分。即申请人必须为当事人或利害关系人，且若不立即采取保全措施，证据将灭失或难以取得； 2．证据保全的范围是否明确。即当事人必须在保全申请中明确请求予以保全的证据内容和范围，不能只是一个模糊的概念； 3．是否具有初步证据及适当的查找证据的线索。即当事人须提供其具有商业秘密，其商业秘密权为被控侵权人侵犯的基本的初步证据，并同时提供给法院有关的查找、调取证据的线索。
（三）法院保全证据的方式。 根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第二十四条：“人民法院进行证据保全可以根据具体情况，采取查封、扣押、拍照、录音、录像、复制、鉴定、勘验、制作笔录等方法。”可知，法院进行证据保全，应依据具体情况采取不同的方法，但必须做到客观、全面、真实的反映证据的本来面目。
法院在进行证据保全时，应尽可能的采取不给被申请人的正常生产经营活动带来影响的手段，如对计算机程序、账本尽可能当场复制副本而不是简单的带走了事等，以免给被申请人带来不必要的损害。