不同组织和细胞对抗病毒药物的调控是不同的

遗传因素宿主的HLA等位基因可以决定对某些抗逆转录病毒药物的敏感性。有些病例显示，当细胞因子受体(如CX3CRl)或细胞因子(如TNF-α-308*2)的多态性与HLA-A2B44单倍体一起出现时，可对抗HIV治疗效果产生重要的影响。细胞色素P-450基因的多态性可以影响血浆中EFV的浓度，还可能影响其他抗病毒药物的浓度。对ABC的超敏反应似乎与HLA-B57*O1有很大的关联。当CD4+细胞数量足够，NVP的超敏反应(肝炎、发热和红疹)与HLA-DRBI*O1O1相关，提示CD4+T细胞参与了对NVP抗原的免疫反应。证据显示，通过细胞免疫，MHCⅡ类分子有助于在抗病毒治疗中控制HIV的复制，尤其是DR*13单倍体与治疗过程中病毒的持续性抑制相关。这些研究表明，在抗病毒治疗过程中，抗HIV免疫反应的参与十分重要。一些研究也提示，编码P糖蛋白(尤其是C／T多态性)的多重耐药转运子基因(MDR-1)的存在，使病人在抗病毒治疗后获得更好的CD4+细胞反应。其他的研究显示，MDR-1可降低CD4+细胞对蛋白酶抑制剂的吸收，与患者对HAART治疗的反应降低有关。上述结果表明，在不同组织和细胞对抗病毒药物(尤其是蛋白酶抑制剂)的调控是不同的，这些研究结果需要进一步的评价。抗病毒治疗对病毒的选择研究表明，对R5和X4病毒可以选择性的使用某些抗逆转录病毒药物，AZT和d4T需要被活化细胞中的激酶磷酸化后方能发挥作用。相反，ddI、ddC和3TC的磷酸化／活化过程是在静息细胞中进行。这些不同可以解释为什么AZT对R5病毒有效，而ddI对X4病毒有效。ddI在静息T细胞中的作用更好，而AZT需要细胞内的活化过程。生物学的研究印证了药理学的发现。R5病毒可以诱导静息细胞的活化，使AZT在这些细胞中能够发挥抗病毒功能。因此，在有些情况下，HAART可以导致X4到R5的表型转换，导致病毒对治疗产生抗性。再者，大多数研究结果显示目前的抗HIV药物能更好的抑制X4病毒。最后，通过趋化因子受体类似物来阻断HIV感染可能会导致病毒选择利用另一种辅助受体来感染细胞。