任务开始是一段克莱尔的形势描述，只要CELL控制着能源，就控制和奴役着人类，CELL的查克曼（zuckermann）能源枢纽被称为X系统，位于百老汇车站地下几百米处的收割厂中，这里守卫严密，是CELL的阿喀琉斯之踵，即主要弱点。抵抗组织在过去几个月蒙受了重大损失，因此克莱尔不得不担起重任，宁可玉碎不为瓦全。
塞可和普若非终于抵达抵抗组织的指挥部，己方部队正在作战，伤员躺在破败的房间里，塞可解释说由于经常面临CELL的追击，所以不得不经常改变基地的位置，克莱尔背对着他们观看着显示器指挥作战，CELL正用数字炮兵进行轰击，作战网络开始瘫痪。克莱尔要求迅速恢复网络，然后转身拥抱塞可，她看上去非常年轻，一头黑发，额头缠着褐色的布条，脖子上有块绿色的围巾，身上是白色的夹克和迷彩裤，这身打扮让她看起来有些另类，似乎不像是个军人，她对站在旁边的普若非非常害怕，觉得普若非经过了太多人为的修改，无法判断是CELL、Ceph或是人类，甚至称他为变异人（mutation）。
塞可掰开电梯门后普若非在跳下的过程中坠到了底部，从那里出来后跳下高坡，来到下面的草地上，有些地方被泉水覆盖，CELL的步兵**在各处，控制自动机枪塔能够减轻不少压力，进入基地入口后控制走廊里的机枪塔，乘坐电梯上楼，但中途CELL切断了电梯的电力，从上面的通风管道出去，干掉外面的几个敌兵。克莱尔告诉普若非富尔顿水坝是自动运行的，但是发电机过载后将会损坏。这个房间的出口用激光封锁，解锁后出门，从码头下水，游到对面的楼梯上去，进通风管道，下楼后弹药堆上能拿到DSG-1狙击枪和JAW火箭筒，在后面控制CELL的防空系统，接近发电机后，克莱尔让普若非让其过载，但CELL步兵追杀而来，普若非拆毁了发电机，电力输出减少到70%，并逐渐下降。
乘坐电梯进入收割厂下去时，克莱尔要求尽快关闭两个发电机，进入工厂时里面弥漫着橘黄色的雾气，其中一个发电机可以直接关闭，另一个要用纳米服关闭。完成后乘坐中央的电梯上去，普若非在这个工厂中产生了好几次幻觉，克莱尔解释说X系统的力场将会严重影响大脑的颞叶，容易产生幻觉。从电梯里出来后消灭那里的CELL士兵，紧急关闭X系统的电力，控制棒弹出后普若非拉出控制棒，关闭了X系统，系统自动转换到备用电源，但是X系统的密封外壳失效，系统在倒数数秒后自毁，普若非从顶端炸飞到另一边的建筑上，他发现原来X系统的能源来源就是Alpha-Ceph，但这并非是他所预见的世界末日，Alpha-Ceph仍可被消灭。