细菌全基因组具有相对较小、重复序列较高、易于突变等特点，所以很必要对微生物进行全基因组测序。细菌de novo测序已取代传统方法成为研究细菌进化遗传机制，关键功能基因的重要工具。 目前，细菌全基因组测序使用三代测序可以得到0 Gap完成图；精确检测结构变异、可移动元件；获得全基因组6mA、4mC表观遗传图谱。
工具/原料
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DNA抽提试剂盒
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建库试剂盒
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三代测序仪：Pacbio RSⅡ 或 Pacbio Sequel
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基因组分析组装软件
方法/步骤
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一、技术路线
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二、生物信息分析 1. 原始数据质量评估 2. 基因组拼装组装 3. KEGG、eggNOG、GO注释 4. 系统发育树 5. 基因家族分析 6. 亚细胞定位
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三、结果展示 1. 数据库使用 Refseq eggNOG 2. 版图展示 图1.1所示，绘制细菌全基因组圈图；
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图1.2所示，全基因组甲基化图谱；
注意事项
样本要求： DNA总量〉10 µg；浓度〉100 ng/µL；260/280为1.8~2.2
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