景炎十四年，清源村中来了一名平凡的少年。村中长者逍遥子见其容貌，知是故人之子。此年恰逢镜湖五年一次的论剑大会。逍遥子欲借机将其引荐于镜湖庄主苏子慕，遂以神兵秘籍相赠，并指点其去桃花源寻找天机门线人采薇。其间少年在颜儿的指点下治好了青姨的沉疴，更帮助彼此有意的菁菁与画师互传音讯。
采薇传授了少年一些基础的驭兽知识后，就让其动身前往凤凰城寻找诗晴。同时告知他菁菁因寻找画师离开清源村后被青衣人围困的消息，少年救出菁菁。后经诗晴告知才知道，菁菁遇险可能源于一本名叫《洗天录》的奇书。凡是与之牵扯上关系的人，无一不遭受青山派的追杀，而久居凤凰城的李婆婆可能知道一些不为人知的秘密。却不想李婆婆根本不愿提及此事，却反请少年帮忙找到孙儿李小遥。从顽皮的李小遥那里，少年结识了闻名桃源的铸剑大师独孤一鸣。
旋即少年返回诗晴处探访菁菁伤势，得知与《洗天录》相关的秘密可能隐藏在画师所赠的一副荷花图中，但画师自上次一别就再无音讯。少年只得再次去见独孤一鸣，并帮其徒仲义平定横行桃源的恶匪。期间意外遇到了失踪多年的独孤一城的点拨，功力大增。后又在桃树下遇到了等待天机阁少掌门慕少渊的明珠，几经周折方才查明少渊竟已为青山派所杀。慕少渊曾于三年前离别之时，赠给明珠一本琴谱。为避免睹物伤情，明珠遂将此份琴谱送给了少年，并嘱托其向李婆婆稍份口信，告诉其不必担心。
此次见面李婆婆态度大为缓和，终同意引荐少年去见桃源六仙之一的桃花老人。恰逢桃花老人养的灵鹿走丢了，少年经过努力帮其寻到了小鹿。作为答谢，桃花老人告诉少年，明珠所赠的琴谱不仅仅是份琴谱，而是牵扯到破解《洗天录》所藏地点的关键。少年重新回到桃花源，见到铸剑大师，得知独孤一城已经重现江湖，身边带着一名白衣少年，名为白羽。此时正在风雪山岭与青山派僵持不下，让少年速速前往支援。少年赶到时，发现那里除了白羽，竟然还有天蝶宫的几名弟子。少年与天蝶梅使用计谋探查出青山派此行目的，原来青山坤位长老名义上要夺取《洗天录》为青山派洗脱罪名，实际却想以此书称霸武林，并且其他青山弟子已在月溪谷有所行动。少年与白羽立即赶往月溪谷。两人战胜了月溪谷终年弥漫的桃花瘴气，又从桃花六仙之二的沈三知那里得到三条锦囊妙计。两人先取得青山弟子腰牌，潜入月溪谷青山派内部，进而消灭前来滋事的天威甲士，取得了青山大弟子的信任。探知了水沉香的秘密，并成功从青山坤位长老那里夺取了水沉香。加上从小童琥珀和镜湖弟子凌舞处得到的两块，少年将此三块水沉香带回独孤一城处。
水沉香上独特的铭文让铸剑大师想起了一个人。她就是镜湖山庄的孙婆婆。在婆婆的指点下，少年独身一人大破镜湖剑阵，获得守阵哑奴的许可，打开凤凰印取走了第四块水沉香。此时独孤一城也出现在镜湖山庄，交代少年将水沉香送至镜湖庄主处。少年先消灭封锁道路的天威枪兵，又途中遭遇了青山刺客，一路险象环生，终于平安抵达。却发现镜湖庄主忧心重重，原来苏妃苏紫颜正在镜湖省亲，眼下局势动荡，庄主十分担心妹妹的安全。少年于是接受了镜湖庄主的请求，去劝说苏妃离开镜湖山庄。却不想苏妃临危不惧，镇定自若。却让少年星夜动身前往王城，叮嘱九公主看护好碧龙金玺，以防有人乘机作乱。
九公主告诉少年，她已遣信使去请小潘相商量对策，却至今不见信使回来。赶到相府后，得知信使已为暗器所伤。原本以为只是普通的王城流匪，却查出匪徒身上竟然带有宁王府的天虎令。此时临近宁王寿辰，宁王正在大肆搜罗寿礼。在为宁王找齐生辰纲、山河图和广陵散三份厚礼后，宁王仍然期望请来德高望重的夏黄公和东园公在寿筵上为自己美言几句，却反而被两名老者戏弄一通。后王城禁军叛乱，少年于乱军之中救出镜湖弟子凌思、凌舞。探飘渺峰，访绝情谷。历经种种，终成一代大侠。
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