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KOBAS软件的使用

KOBAS主要用于对基因进行KEGG注释
工具/原料
1

一台可以连接互联网的电脑

2

等待注释的基因序列或者蛋白序列或者基因编号

方法/步骤
2

注册账户。可以不注册。但是注册之后可以保存你的输入文件和分析结果文件,有利于后面的查询。

3

注册之后,就可以使用用户名登陆了。当然,如果你之前已经有用该用户名进行数据的分析,那么你可以查询到你过往的数据分析结果。

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基因的注释。输入的可以是基因的序列,也可以是编码蛋白的序列,也可以是NCBI上的gene ID等等。输入文件可以从已经上传到网站服务器的文件中选择,也可以直接粘贴到对话框,也可以选择新上传文件。下面的框框中选择你要比对的数据库,修改输出的文件名,点Run就可以了。

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Annotate + Identify  中,则可以对输入序列进行注释之后,对他们进行富集聚类。方法与Annotate大同小异。

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由于该网站规定最多一次注释序列500条。因此可以选择下载脚本创建本地版分析软件。

注意事项
1

最多只能一次使用500条基因序列。

2

最多只能同时执行5个任务。

3

服务器拥挤的时候,需要排队。

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