如果车辆的制动牵引力没能准确执行ats提供的信号，或信号系统软件出现小问题——提供的信号不够精确，就会出现地铁门没有正对屏蔽门打开的情况。偏差过大的时候，司机就会把自动控制切成手动，调整对位。在信号系统正常工作并无紧急情况时，司机除精确停车外无需手动控制。在信号系统硬件或软件出现故障或出现紧急情况，则由自动控制降级为手动控制，考验司机以及行车调度的时候到了。
为了锻炼地铁司机手动驾驶水平，确保ATS失效时司机仍能娴熟安全驾驶，都会在特定时间段安排司机手动开车，如南京地铁安排在晚八点后，上海地铁安排在周末，这时停不准的情况可能就出现得比较频繁，甚至不准得离谱了。
ATO可以辅助列车精确停靠，但是ATO为什么能做到呢~~以下就是所谓的“电脑控制”的过程。
线路地图。ATO的“脑海”里会记忆一张叫线路地图的东西，这个地图上绘制了整条线路的情况，哪里是站台，哪里是道岔，哪里该停车等等~~在站台，屏蔽门(PSD）是根据车门位置安装的，会比车门的大小大那么一点点，在站台停好之后，车头所在的点叫做SSP（service stop point）。SSP的设置确保，车头停在这一点，车门刚好是对准屏蔽门的。在停车过程中，ATO不会去找门，而是去找点。
列车定位。那么问题来了。ATO怎么知道车在哪里呢~~传统的检测轨道占用的方式，只能知道列车在哪个区段，但是要做到精确定位就不行了。通常精确定位，要用到一个东西叫做信标（beacon，也叫应答器）,就是下图那个黄黄的东西（图片来自网络），大家坐地铁的时候可以注意观察下，大多数线路都能看到轨道中间有这个东西。（国内大多数厂家用这种方式）。
简单来说，当列车驶过这些信标，车上的接受装置，就会知道，我已经到这个点啦，后面会根据列车行驶的速度来计算自己的定位。但是速度采集和计算误差是比较大的，所以一般线路上，每隔一段距离，就会布置一个信标，来校正列车的定位。而站台会布的比较密集~~毕竟精确停靠要求比较高嘛（精度要达到0.5m）。过程大概如下图所示，框框为ATO计算的列车定位。ATO会根据自己的定位和目标停车点，计算自己的速度曲线，以保证停下来的时候刚好停在SSP点。