Java实现生物信息小软件,通过Java对生物信息学的一些算法实现,例如序列比对,作图,统计等。对序列的初步处理,匹配搜索等。
工具/原料
1
Java
2
Netbeans
方法/步骤
1
开始界面创建,是一个打开窗口,用于打开文件JFileChooser包,以及JTextArea
2
序列比对之全局比对。使用JTable作为结果显示,使用Needleman_Wunsch、Smith_Waterman算法
3
点阵图,使用Graphics包进行绘图。以图像的形式表示序列的相似性。
5
模式序列搜索及统计使用Sunday算法。统计模式串的数量以及位置。
6
序列信息统计,对核酸或蛋白质序列进行统计。对某些核酸的数量进行统计。
7
帮助文档
注意事项
1
相关代码不附上
2
对于Java需要熟悉
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