多语言展示
当前在线:1925今日阅读:75今日分享:44

10x Genomics应用于肿瘤耐药研究

随着“人类细胞图谱”计划的开展,单细胞测序技术已经进入2.0时代,尤其,基于微液滴或者微流控芯片技术的高通量单细胞分选平台的出现,引领生命科学研究进入单细胞生物学时代。
方法/步骤
1

研究重点技术:低通量全基因组DNA测序、深度靶向测序、L1000表达谱测序、10x单细胞转录组测序器官/细胞类型:MCF7细胞系(人乳腺癌细胞系)样本量:两个亲本和四个单细胞衍生克隆(且存在不同时间点取样)细胞数:26,465

2

文章思路      本研究先利用公开发布的多平台数据证明遗传变异与平台及其他人为误差无关,然后对MCF7细胞的基因组和转录组进行研究,发现遗传变异的来源,并利用其他细胞系证明该研究的普适性,最后对细胞系进行药物处理,将遗传变异与药物处理相关联,以便于为药物治疗提供研究新思路。

3

文章结论1. 细胞异质性既来自克隆动力学,也来自连续的遗传不稳定性。2. 遗传异质性导致基因表达的不同模式,反过来也会导致不同的药物敏感性。

4

天津生物芯片10X genomics单细胞转录组测序优缺点10x Genomics单细胞转录组测序优点1、简单便捷:集单细胞分选、扩增、建库于一体;2、细胞通量高:每个样本细胞数可达500-10000个;3、建库周期短:1天可完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增及建库;4、超高捕获效率:单细胞捕获效率高达65%;5、真正意义的单细胞:单个液滴捕获到多个细胞的概率极低(0.9%/1000cells);6、价格实惠:相较于其它单细胞平台,价格实惠。10x Genomics单细胞转录组测序缺点1、非全长信息:只能获得3’端转录本信息;2、样本要求高:单个样本细胞起始量达10^5-10^6个,活细胞数目需超过80%,建议在90%以上最佳。

5

天津生物芯片10X genomics单细胞转录组测序技术流程

推荐信息