二代测序及科学研究的快速发展，菌种鉴定也由DNA-DNA-杂交的生化实验专项基于核酸序列的两两比对。相比镜检、生化实验和传统药敏和血清型试验，基于全基因组测序的菌种鉴定也迎来了更方便的手段，同时，也使得菌种鉴定结果更为准确精细。
工具/原料
1
细菌基因组总DNA
2
高通量测序整套系统
3
MicrobeTrakr
方法/步骤
1
待测菌株的DNA提取，手工提取或者试剂盒提取皆可。DNA浓度≥100ng/ulDNA总量≥1.5ugOD260/280：1.8-2.0
2
测序文库构建上机测序。或者测序。测序深度不小于30倍
3
测序数据用MicrobeTrakr plus直接分析得到鉴定结果。或者测序数据拼接，拼接好使用MicrobeTrakr直接分析得到鉴定结果。