由于在寇谦之的挑唆之下，北魏武帝下令开始灭佛。得知长安郊外的万佛寺藏有一颗象征这佛祖精神的佛舍利，所以派大将军拓跋鸿胤带领军队前往万佛寺，剿灭妖僧并摧毁有着精神象征的佛舍利。万佛寺主持慈恩大师得知这一情况后，遂让手下弟子慧明、慧聪保护佛舍利出逃，自己带领一干弟子挺身抵抗众官兵。
在师傅慈恩的奋力抵挡之下，慧聪和慧明终于保护着佛舍利逃了出来，但是身后不断的有追兵。不久之后他们来到了一处悬崖，却被官兵围住，就在生死之间，一个神秘的男子突然冲了出来，以迅雷不及掩耳之势将围堵的官兵杀死，然后又逼问出当年一件震惊整个江湖的惊天秘密。这位男子就是宗正。本作的主角。原来宗正的妻子就是那场惨案的受害者，宗正一直在寻找杀妻仇人，但是一年来也未能找到，原本他已经绝望了，想一死了之，没想到今天尽然意外的找到了线索。经过士兵的围殴，小和尚已经奄奄一息了，最后小和尚将佛舍利交给了宗正，希望他能将佛舍利带回万佛寺。宗正感念小和尚的一片赤诚之心于是就答应下来了。小和尚将随身携带的法宝青铜镜转赠给宗正。
于是宗正带着佛舍利向万佛寺前进，路上偶有小战，宗正都能轻松的应对，没多久，宗正就来到了建德城，巧遇当地官宦正在欺压良民，宗正顺手将其救下，却没想到，被自己救下的少女竟然是自己的小姨子——诗雨。宗正知道此行一定非常凶险，所以他并不打算认诗雨，但是诗雨却是十分肯定，她眼前的这个人就是她的姐夫。即便宗正不愿意带着她，诗雨也要偷偷的跟在后面。拒绝诗雨后，宗正继续前进，没走多久却遭到了刚才那班官宦的暗算，宗正中毒倒地，醒来时，他已经在阴暗潮湿的地牢里了。
经历了一顿又一顿的皮鞭后，宗正终于不支倒下了。等他醒来的时候，他已经被关在了牢笼里，这时，他发现身边还有一位姑娘。没错，正是诗雨。原来被宗正拒绝后，诗雨一直觉得不服气，于是暗中跟着宗正，发现宗正中毒倒地后，诗雨赶忙走上前来，不了却被官府抓个正着。诗雨用柔然的灵药帮助宗正疗伤，宗正瞬间恢复了内力，决定带着诗雨逃出地牢。但宗正始终不承认自己就是她的姐夫。逃出地牢后，宗正和诗雨发现自己已经被大量的官兵所包围了，一度反抗后，宗正体力不支加上体内还有残留的毒素，最终导致他毒发倒地，官宦下令将他二人以勾结妖魔为由下令当场斩首。就在这千钧一发之际，从天空中飞出了几支利箭，将敌人一个一个都杀死。官宦恐慌，带着一干士兵逃走。
元翎青将宗正和诗雨救了出来，元翎青本是想北上万佛寺去营救自己的父亲，正好三人有着相同的目的地，于是就结伴而行。出了城，没走多久，三人又遇上可朝廷的官兵，三人联手，事情自然更加好办了。战斗过后，宗正由于使用内力导致体内毒发，恰好被正在采药的老人所救，三来一同来到紫风的家中。之后宗正醒来，发现诗雨不见了，询问之下才知道，为了救宗正，诗雨孤身前往永安城，去用她的内力换取解药。于是宗正和元翎青前去阻止诗雨。
出了屋子，一直向南走就能到达万灵山，经过一张地图后向北走就能到达永安城。在永安城，元翎青发现一栋房屋门口被门派堵着很可疑，于是二人查探，竟然发现屋内另有洞天，二人来到地牢尽头，发现诗雨正被绑在刑架上，此时的诗雨已经开始虚脱了。宗正和诗雨将其救下，此时紫风也赶到，原来这一切都是紫风的阴谋，是他借助官宦之手让宗正中毒，为了是要得到诗雨的纯净内力，以达到他不可告人的秘密。宗正得知，气氛不已，和元翎青联手将其击败。之后他们救醒诗雨，三人继续向万佛寺进发。
揭穿紫风的阴谋后，宗正一行三人来到了万佛寺，发现这里已经有士兵守卫了，于是他们抓住一个士兵逼问出万佛寺的情况，原来，寇谦之派出的军队攻占了万佛寺后就把一些和朝廷作对的人全部囚禁在万佛寺的地牢内。于是三人进入地牢，击败了守卫的拓跋鸿胤，救出了元翎青的爹元辰方和万佛寺方丈慈恩。慈恩要求宗正将佛舍利送去明法寺保存。一干人逃离万佛寺来到的附近的一个小村长——高塘村。当年宗正的妻子就是在高塘村大火中丧生，但是元辰方来到这里也无限感叹，并且众人得知当年下令放火的正是元辰方。宗正得知后，欲亲手杀死元辰方，但是遭到元翎青的阻止，宗正一激动，体内毒性发作，元翎青趁机带着爹爹逃走。待到宗正恢复过来，朝廷的追兵也正好赶到，将宗正和诗雨抓了起来。
在牢中，诗雨使用美人计骗取了牢门钥匙，二人击败守卫上官弘后逃出地牢，偶遇元翎青。原来元翎青的父亲已经被官兵杀死了，元翎青在父亲的掩护之下，勉强的逃了出来。随后三人一同来到明法寺，正好遇见寇谦之正在率兵攻打明法寺，三人帮助明法寺渡过一劫。宗正身受重伤。寇谦之用最后一点力气偷袭宗正，却被元翎青挡下。众士兵见寇谦之被杀，要全力攻入明法寺，就在这千钧一发之际，诗雨挺身而出，将士兵挡了下来。明法寺的武僧趁机将宗正救走。过了几天，宗正苏醒了过来，在得知元翎青已死，诗雨下落不明后，将佛舍利存放好后，失意的再次踏上寻找亲人的路途。