目前女性黄体功能不足的发病机制还不太明确，但是一般和下丘脑-垂体-卵巢这一性腺轴的功能有关。下丘脑-垂体-卵巢性腺轴的功能的完善对于正常女性黄体机能的维持是很重要的，所以目前大多数学者都是认为黄体功能不全的原因有可能与垂体分泌的黄体生成素(LH)、促卵泡成熟素(FSH)的不足有关系;或者是垂体分泌的催乳素(PRL)过多、过少等因素有关系。
症状
1
不.孕：因为黄体无法按期的萎缩退化或是不完全退化，持续分泌少量的孕激素，会造成子宫内膜无法按正常时间发生剥落，经前子宫内膜仍旧是停留在早期分泌的阶段，是女性很难受孕。
2
月经失调：部分的黄体功能不全患者病人，是可能会发生月经失调症状，比如月经周期缩短、或是月经过多或是过少、经期延长等症状，严重的危害到女性健康。
3
流产：因黄体功能不全无法分泌出足够的孕激素。所以，即便是黄体功能不全的女性患者正常的受孕以后，也是很难维持正常受孕，从而会引发流产、习惯性流产现象的发生。