目前已知可用的修补材料包括自体骨、有机玻璃（亚克力）、丙烯酸骨水泥、钛合金金属和聚醚醚酮（PEEK材料），在可能的情况下，颅骨自体骨是优选的，特别是在较小的婴儿中，但是由于自体骨不易保存，所以除非特殊情况，否则很少有使用自体骨来作为修补材料的。
有机玻璃与骨水泥：有机玻璃和骨水泥在以前的很长一段时间被用于作为修补颅骨的材料，但是最终由于因其临床效果差，排异反应频发而被淘汰，逐渐退出医学舞台。其中丙烯酸骨水泥，凝固时会难以模塑和脆化，甚至导致植入物的松动。造成手术失败。
钛网材料的优缺点：现今常用的颅骨修复材料是钛网，也是应用时间长、效果较好的一种优质材料。而且价钱也便宜，大多数家庭还是可以承担起的。但钛网的金属属性，往往会给患者带来冷热反应敏感、CT影像失误等后果。但是钛板通常是用钛钉来进行固定。这些很容易造成感染，往往带来的是头皮积液严重，排异反应频发。
新世纪兴起的新型PEEK材料：从2000年开始，PEEK（学名：聚醚醚酮）就已经开始应用在颅骨修补手术中。这种是一种特种高分子材料，采用嵌入式手术修补，具有：无切割性伤害，隔热好，对头皮刺激小，舒适，硬度高有弹性，三维重建高度还原等优点。在综合15篇文献，并对183名使用PEEK颅骨患者进行Meta分析，对自体骨、钛网和PEEK这三种修补材料进行对比，结果发现PEEK材料不管在术后并发症率还是手术失败率上，都低于自体骨和钛网这两种材料。作为国内较早使用这项新材料的穆苍山教授发现，这项新材料在临床上效果十分理想，对比钛金属网有着巨大的优势。
一般而言，颅骨缺损不管是因外伤还是因手术造成的，一般都需要三个月左右的时间再进行颅骨修复。当然还需要对患者身体症状进行总体评估，看适不适合手术，有没有什么禁忌症，及时处理。一般而言，三个月左右的时间是比较合适的。