小RNA是一类内源性的具有调控功能的非编码RNA，主要包括miRNA、piRNA和siRNA等；它的功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，在发育、病毒防御、造血过程、器官形成、细抱增殖和凋亡等环节起着重要调控作用。 小RNA测序目标： 1. miRNA长度，茎环结构，miRNA前体加工，靶基因结合位点和预测； 2. 转录组和小RNA数据的联合分析。
工具/原料
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高通量测序平台：Hiseq等
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生物信息学分析
方法/步骤
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一、技术流程
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二、生物信息学分析内容 1. 测序质量分析与统计、评估； 2. microRNA，rRNA，tRNA，intron，exon，snRNA，snoRNA注释； 3. microRNA的表达量差异分析； 4. microRNA表达模式聚类分析； 5. microRNA保守性分析； 6. microRNA与靶基因之间的调控， microRNA靶基因之间的蛋白-蛋白相互作用网络分析； 7. 靶基因预测； 8. 新miRNA预测。
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三、结果展示 1. 数据库使用 2. 版图展示
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四、样本要求 总量：〉4 µg RNA；浓度：〉50 ng/µL