BioEdit是一个序列编辑器与分析工具软件。功能包括:酶切位点分析、序列编辑、外挂分析程序、RNA分析、寻找特征序列、支持超过20000个序列的多序列文件、基本序列处理功能、质粒图绘制等等。下面我就给大家介绍如何使用BioEdit来查找DNA序列的酶切位点,从而设计合适的引物。
工具/原料
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生物信息学软件:BioEdit
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你所要分析的DNA序列
方法/步骤
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百度搜索:BioEdit下载
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安装之后,打开软件,显示以下画面:
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依次点击BioEdit软件的'file>open>'将“文本文档 sequence1”打开:
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选中“sequence1”后,选中标题栏中“sequence”>'Nucleic Acid'>'Restriction Map'
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在新的界面中选择“Generate Map”
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在出现的界面中,即是分析得到的酶切位点图,可以显示每个酶切位点在序列中的位置,拖滚动条到最下面,可以看到酶不能切割的酶切位点。
注意事项
序列必须保存成fasta格式
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