免疫检查：免疫性流产包括有同种免疫紊乱和自身免疫异常。同种免疫紊乱的排查需要做封闭抗体，夫妇HLA配对等检查，目前封闭抗体是检查最多也是最实用的，假如封闭抗体呈阴性，则表明母体不能产生对胚胎有保护性的“封闭抗体”，胚胎将会受到母体免疫细胞的攻击而容易发生停育；自身免疫异常则需要通过检查母亲体内抗体如抗磷脂抗体、抗精子抗体，抗孕激素抗体，抗雌激素抗体等，医生必须找出哪种抗体对习惯性流产的影响较大。
解剖因素检查：解剖因素造成习惯性流产主要包括以下几个方面：宫颈机能不全、子宫发育畸形（如子宫纵隔、单角子宫、双角子宫、鞍状子宫等）、子宫肌瘤或腺肌瘤、宫腔粘连等。诊断主要依靠超声、宫腔碘油造影、宫腔镜、腹腔镜、宫颈扩张器等检查。
内分泌诊断：导致流产的内分泌异常包括妇科内分泌和内科内分泌异常。妇科内分泌异常包括常见的有黄体功能不全、高催乳素血症、多囊卵巢综合征等。妇科内分泌异常要经过基础体温测定（BBT）、子宫内膜活检、激素测定、血清泌乳素（PRL）测定等检查；内科内分泌异主要是糖尿病和甲状腺功能异常，相关疾病以及激素也要进行检查。
血栓前状态诊断：作为国内率先提出凝血前状态与习惯性流产有关的第一人，张教授指出，血栓前状态的诊断需要对患者凝血功能进行检查，凝血功能检查相当复杂，目前能做的检查还只是凝血功能全貌的冰山一角，加上凝血功能检查费用较高，目前医院开展的检查项目还比较有限。
习惯性流产病因较复杂，检查也相对繁琐，那么排查病因整套检查花费是否也会比较高呢？张教授告诉我们，习惯性流产整套检查当中，夫妇染色体检查费用是最高的，夫妇其中一方的染色体检查大概费用在1300左右，双方同时进行检查，花费在2700元左右。其他所有检查包括免疫检查，内分泌检查等费用相对要低，习惯性流产整套检查需要的大概费用在4000-5000之间。