在净化水设备中，一般来讲原水中均含有一定量的微生物（细菌、真菌、病毒、细菌），微生物进入反渗透系统之后，找到了水中溶解性的有机营养物，这些有机营养物伴随着反渗透过程的进行浓缩富集在反渗透膜表面上，从而形成生物膜的理想环境造成膜元件的生物污染，生物污染将严重影响反渗透系统的性能使得进水至浓水间的压差迅速增加，导致膜元件发生“望远镜”现象与机械损坏以及膜产量的下降。
方法/步骤
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1.活性炭吸附：用活性炭吸附水中有机物减少微生物的营养源，但吸附有机物的活性炭又成为营养充足的微生物理想繁殖场所；
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2.紫外线杀菌：水经过紫外线照射后，细菌的细胞核中脱氧核糖核酸和细胞质中的核糖核酸吸收了波长为250—265nm的紫外线能，而被破坏导致细菌死亡。但由于水中的浊度、色度、藻类以及某些离子会减弱紫外线杀菌的作用，因此应该将紫外线杀菌器安装在预处理设备之后；
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3.混凝：微生物可视为胶体带负电荷，用常规预处理方法如混凝、澄清和过滤可除去大部分，但很难彻底去除；
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4.超滤：超滤膜具有较强的的过滤细菌能力，但不能保证彻底除菌，为了防治被截留细菌在超滤中大量繁殖，必须定期清洗超滤器，包括快速冲洗、反洗、药洗和杀菌等；
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5.杀菌剂杀菌：用杀菌剂控制微生物非常有效，常见的杀菌剂为具有氧化能力的化合物如CI2、NaCIO、O3、KmnO4等。杀菌剂的加药点应该尽可能安排在靠前工序中，以便有足够的接触时间使得在进水膜装置之前完成消毒过程；
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6.电子除菌：电子除菌器实际上是一个低压电解槽，被处理水通过电解槽，带负电荷的细菌吸引到正极，细菌的细胞与电极间产生的电子转移反应降低了细胞的吸氧活性；
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7.定期消毒：即使采用了上述杀菌手段，细菌仍会有少量存活。因此有必要进行定期消毒。
注意事项
温馨提示：电子杀菌和臭氧杀菌具有一定危险性，非专业人士请勿擅自进行杀菌操作；
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