APP的开发周期长，一款完善的双平台APP开发周期约3个月；而小程序的平均开发周期为2周，仅为APP开发周期的六分之一。
APP在开发时需要适配商场上许多主流的手机型号，开发成本大；而小程序只需一次开发就可以自动配适所有的手机型号。
APP需要用户主动下载，对网络环境的依赖性较强；而小程序只需通过二维码、v\x搜索、好友分享等方式便可直接获取和进入。
APP安装在手机内存中，会占用大量的内存空间；而小程序不需要安装，召之即来挥之即去，并不会占用太多手机内存空间。
APP存在大量的广告信息，并且隔三差五就需要更新；而小程序是不允许给用户主动推送广告的，也无需更新。
APP市场饱和度高，几乎所有领域都有大头覆盖；而小程序还是一片蓝海，在使用场景下可以有很多市场机会。
APP面向所有智能手机用户，约25亿，是一种多而广的市场环境；而小程序仅限v\x用户，约9亿，是一种少而精的市场环境。
APP可以实现较为完整的功能，灵活性、功能性较强；而小程序仅限v\x提供的接口所支持的功能，便捷性和精确性较强。
APP发布上线需要向所有应用商店提交资料，流程繁琐，消耗的时间冗长；而亿仁网络小程序发布只需要提交到v\x公众平台审核，快捷又方便。
由此可见，小程序其实可以说得上是APP的精简版。但是，两者又各自有各自的优势与劣势。小程序同样可以实现很多的功能，且小程序依托v\x的流量入口，带来一定的客户，提升用户粘性。甚至是可以直接取代低频的APP。且那些低频、非刚需、轻量级、功能单一、不需要调用太多系统能力的应用貌似更适合制作成小程序，也就是说，小程序其实是可以取代那些低频的APP的。
同样，低频、非刚需、轻量级、功能单一、不需要调用太多系统能力也是小程序所存在的软肋。当面对一些高频、刚需、功能要求大的需求时，小程序相对于APP来说就显得比较弱势了。
所以，小程序对或者商家来说是一个很好的选择，因为其开发时间短、成本低、效应强。而APP则适用于那些大型企业和涉及范围广阔和所需功能性强的领域。