安装电子身份芯片。输入日本的犬猫等须安装符合ISO11784和11789标准的电子身份芯片。根据使用说明部位进行安装，安装后须确认电子身份芯片安装妥当。使用芯片读取机可以读取镇动物狂犬病预防接种、使用狂犬病病毒中和试验检测抗体、出国前进行临床检查时资料，并可以进行个体识别。如果使用的是不符合ISO标准（11784和11785）电子身份芯片，无论是已植入的或新植入的，进口商在动物入境时须提供读取芯片的机器以确认动物的身份。但是，动物检疫所也有些不是按照ISO标准的芯片读取机．在动物到达口岸前，请与动物检疫所联系。
进行狂犬病免疫接种。动物在安装芯片后，至少接种狂犬病疫苗（符合OIE规定灭活疫苗）2次以上。在安装芯片前，动物接种的灭活疫苗或弱毒疫苗不能计算到这里，须重新再次接种。接种疫苗犬猫须为91日龄以上，而且第2次接种须在第1次接种的免疫有效限内，并与前次接种间隔30天以上。但对于动物到达日本时超过其有效免疫期限的，须追加接种疫苗。
使用狂犬瘸病毒中和试验检测抗体（也就是狂犬病血清抗体测试）。采血时期：在接种芯片后，进行了2次以上免疫接种狂犬病疫苗后，而且在最后一次免疫接种有效期限内。将血液送往农林水产省指定的实验室，进行抗体效价检测。抗体效价须在0.5IU/ml（每lml血清中0.5个国际单位）以上。该检查结果自采血之日起两年内有效。请注意如果动物在两年内未到达日本，该检查结果无效。实验室名单可以在PetSino网站上查询。
检测抗体后出口前须等待期限。对于到达日本后，隔离检疫在12小时以内完成的动物，自前面所述采血日起须经过180天但在2年期限内到达日本。自采血日起不到180天的动物，须在动物检疫所内隔离检疫差额天数。注意：如果在等待期间，超出狂犬病预防免疫期限时请再追加免疫。
预先申请。在运送动物的船舶或飞机到达最少40天前，进口商须以传真或信件的方式向机场（港口）所在的动物检疫所提供一份预先申请。输入犬时，进口商须提交（犬进境检疫申请）；输入其他动物时，提交（根据狂犬病预防法进境动物检疫申请）。如果进境动物发生改变勿须提供其他信息时，还须提交（进境动物更改申请）。上述相关表格可以从动物检疫所网站下载。动物检疫所也可以与进口商联系，讨论检疫计划等事项。因此，请进口商在提交申请中清楚注明联系方式（电话号码、传真号码或电子邮箱地址）。
进境动物检疫许可。动物检疫所收到申请后将会向进口商签发（进境动物检疫许可证），一般会以传真、电子邮件或信件的方式通知申请人。如果申请人还须向其他机构申请，请注明。在动物进境时须检验许可证受理号，因此，请妥善保管。当你办理动物装船/机时，船务/航空工作人员要求你出示“进境动物检疫许可证”。
输出前的临床检查。在输出前（尽可能在出境前两天内），由兽医对该批动物进行—次临床检查，以便证实该动物没有或怀疑患有狂犬病（对于犬，须声明没有狂犬病与钩端螺旋体病）。
从输出国政府官方部门获取健康证书。进口商须获得输出国政府官方部门签发的动物健康证书，并在入境时提交给当地的日本动物检疫所。如果该证书由实施临床检疫或检疫处理的私人兽医签发，那么在入境时，进口商还须提供输出国政府官方认可该兽医的相关资料（如：官方兽医的签名，姓名、封识以及输出国政府官方机构印章，签发日期），否则该证书无效。
注射芯片 。要装国际标准化机构（ISO）的样式，适用于11784或者11785的微型芯片。具体的芯片购买和植入您可以咨询PetTour中国的工作人员。
疫苗的注射。装好芯片后，需要注射至少两次以上的灭活疫苗。（要求两次疫苗间隔30日以上，而且要是有效期内）如果是幼犬，则在生后91天以后注射狂犬疫苗。除了狂犬之外您的宠物还需要免疫的疫苗有： 犬：犬瘟热、传染性肝炎（B型腺病毒）、细小病毒混合三联苗（建议对副流感、钩端螺旋体、传染性冠状病毒进行免疫）； 猫：猫病毒性鼻气管炎、猫卡利病毒、猫泛白细胞减少症混合三联苗。 疫苗的免疫最好到当地出入境检疫局认可的宠物医院进行，以免出境的时候，出入境检疫局不认可。
申请入境许可。出发的40天之前， 向你到达的机场动物检疫所提出申请。
狂犬病的血清检查。 因为是进入日本的审查。血清的检查要在日本有关机构指定的地方进行。这个目前国内没有。就是说你要把血清寄到国外检查。关于采取血清向宠物医院咨询，也可以咨询PetTour。 如果自己办理的话，可以在PetSino上查询日本检疫所认可的宠物狂犬病血清抗体的检测机构名单，然后直接带宠物前往出入境检疫局指定的宠物医院采集血清，申请出境健康证明，然后带血清到日本或者其他认可国家的实验室检测。
出国前要求临床检查。这个主要包括驱虫和健康体检。 建议在输出前（离境前四天）进行以下驱虫处理： 外寄生虫：使用有效的除螨、除蚤药物进行处理，并在出口前进行一次临床检疫以确定该动物没有这些寄生虫。 内寄生虫：使用有效药物清除线虫、绦虫。
办理出境的官方健康证明和通关文件。拿到宠物医院的体检合格证明之后，可以到当地出入境检疫局换取《动物卫生证书》和《通关单》。此外，您还需要在宠物出发前1-4天通过电话、传真、E-MAIL联系向进境动物检疫所预报，提供事先申请的受理号、到达航班号（船号）、预定到达机场（或海港）以及预定到达时间等信息。
宠物到达检疫和隔离。如果上面的手续都办理的很顺利，符合日本的要求，宠物在日本只需要12个小时的隔离检疫。如果不符合日本的要求，或者在机场检疫隔离12个小时的时候发现问题，宠物需要面临180天的隔离检疫期。因此强烈建议将所有的手续确认无误之后再将宠物送到日本。