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Diamond作图,晶格结构图原子和多面体的调节。

晶格结构图是展示一种材料微观结构非常有用的一种示意图,因此在做晶格结构图的时候关于晶格结构图中原子和多面体的设置是非常关键的,在此我们就基于diamond软件来具体介绍调节原子的方法,同时介绍diamond软件的使用方法。
工具/原料
1

计算机

2

diamond软件

方法/步骤
1

首先,如图(1)所示,我们已经构建了一个材料的晶格结构图,关于这个晶格  结构图的构建和调节大家可以参考我们之前的分享(https://jingyan.baidu.com/article/5225f26b8d56d5e6fa0908db.html)中有具体的介绍,在此我们就具体关于原子和多面体的调节做具体分析,第一,关于原子大小和颜色的调节的具体步骤是:点击上端工具栏中的picture→atom design,得到如图(2)所示的对话框。

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第二,在得到上面的对话框之后,我们就可以对原子的大小和颜色进行调节了,如图(3)和图(4)中的氧原子,我们想把它调节成亮绿色而且大小是最小的原子,具体过程就是在atom design的对话框中调节氧原子的填充颜色和边界颜色,一般取同样的颜色,然后关于原子的大小可以根据具体的实际情况在model and radii中修改原子的半径(可以参考元素周期表中的原子半径来设置),最后我们点击ok就能得到如图(5)所示的结果。

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最后,我们调节好原子之后,就需要添加多面体了,具体过程是:点击工具栏中的build→polyhedra→add polyhedra,就能得到如图(6)所示的对话框,然后我们想把钙设为中心离子,氧设为配位离子的多面体,具体过程就是central atom group选中Ca, ligand atom group选中O,点击确定就能得到如图(7)所示的结果,关于多面体的具体调节我们后面再做具体分享。

注意事项
1

图片原创禁止转载商用

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