鼬的真正实力。这里探讨的鼬还是讨论生前的实力，之所以会存在这个争议或者说未解之谜。是因为秽土鼬的实力超级无敌强，封印长门击退兜，简直逆天。这也是鼬迷声称鼬神无敌，秒天秒地秒空气的重要原因。但是显然生前鼬和秽土鼬的实力不在一个档次上，没人知道，所以鼬的真实实力也因此成为火影未解之谜。
大蛇丸摧毁木叶之谜。大蛇丸曾经跟兜说过他子所以对木叶出手的原因是为了夺取木叶还有佐助，但是这里面存在着两个巨大的疑点。一：大蛇丸的实力已经强大到可以夺取木叶了嘛？事实上并没有，就算三代不会使用尸鬼封禁，大蛇丸想要打败他也需要消耗大量查克拉，在消耗完大量查克拉的情况下，还能成功吗？二：为了佐助，有必要差点赔上自己的小命吗？两者有什么不可告人的关系吗？大蛇丸究竟是何目的，恐怕只有他和岸本知道，注定将成为火影未解之谜！
秽土斑为何是中年状态且拥有轮回眼。按照已有的资料，秽土转生的召唤的死者灵魂，死者生前是怎么样的，秽土转生后也应该一样。可是秽土斑却是中年状态并且拥有轮回眼。斑曾说过他快死时才开启轮回眼，所以中年状态的斑是不具备轮回眼的。其次，斑是如何装死骗过初代呢？作为木叶的首领，斑的首领应该会被回收，那么怎么能逃脱木叶的情报分析机构呢？究竟这一切是怎么回事，恐怕只能等岸本解答了。
别天神具体有多么强。别天神在火影中被称为最强幻术，能够操纵别人的思想。但是作为拥有者止水，却并没有当上火影。所以这所谓的最强幻术难免让人存生一丝怀疑，究竟这个忍术是操控别人的思想呢？还是仅仅只让人存生施术者的想法呢？还是不得而知。
宇智波叛变之谜。带土曾说过：宇智波家族之所以叛变的原因，是因为遭到木叶上层的排挤想要发动政变夺取政权。关于这次叛变，有两个疑点。一、宇智波家族凭什么具备夺取木叶政权的实力。根据宇智波显示出来的实力，一夜之间被鼬以一己之力抹去，实在是想不出他们有什么底气能够发动政变？二：富岳打算让鼬杀掉排挤宇智波的高层，从而让宇智波得以再次被重用。富岳能够清楚地察觉到鼬其实是不配合的，甚至反对的，那么为什么还一意孤行地发动叛变呢？