颜色：真玛瑙色泽鲜明光亮，假玛瑙的色和光均差一些，二者对比较为明显。天然红玛瑙颜色分明，条带十分明显，仔细观察，在红色条带处可见密集排列的细小红色斑点。用石料仿制的假玛瑙烟壶，多数在底部呈花瓣形花纹，络成“菊花底”；而染色蓝玛瑙颜色艳丽、均一，给人一种假的感觉。
质地：假玛瑙多为石料仿制，较真玛瑙质地软，用玉在假玛瑙上可划出痕迹，而真品则划不出。从表面上看，真玛瑙少有瑕疵，劣质则较多。
工艺质量：优质高玛瑙的生产工艺严格且先进，故表面光亮度好，镶嵌牢固、周正，无划痕、裂纹。
级别：水胆玛瑙是玛瑙中最为珍贵的品种，特征是玛瑙中有封闭的空洞其中含有水。 各种级别的玛瑙，都以红、蓝、紫、粉红为最好，并且要求透明、无杂质、无沙心、无裂纹；其中，块重4.5公斤以上者为特级，1.5公斤以上者为一级，0.5－1.5公斤为二级。
在选购玛瑙时，应从其颜色、透明度、材质和温度这四个部分来进行辨别： 颜色特点：真玛瑙的色泽鲜润具活性感、纯正、厚重、协调；而假玛瑙的色和光都不自然，往往艳丽轻浮。而有的有年份成品物，可能出自酸碱度较高的老坑，通常光泽减少，色度减少，透明度减少，当然，因其表面老化斑驳的贵重美感而改变身份。
透明程度：真玛瑙透明度不高（否则已至水晶界线），有的能看见自然水线或“云彩”“丝絮”。而人工合成的玛瑙透明度好，甚至像玻璃球一样透明，往往不自然。
材质：假玛瑙是用其他石料仿制，特别是其料易碎或轻软。通常，玛瑙比较结实，多数非酸碱影响的玛瑙利茬可在玻璃板上可划出划痕来。真玛瑙首饰比人工合成的玛瑙首饰重一些。
温度：真玛瑙（尤其未受酸碱等改变因素影响新料）冬暖夏凉，而人工合成的玛瑙随外界温度的变化而变化，天热它也热，天凉它也凉。
天然玛瑙和假冒产品的最显著的区别，就是横断面有没有同心层纹结构。然而，整块玛瑙较为容易识别，而经切割后的制成品，没有明显整齐的图案，容易认错。但一般来说，天然玛瑙手感凉，表面像涂了一层蜡，并有蜡的光泽；半透明；硬度在莫氏7级以上，用小刀刻不动；由于它是在溶融状态下形成的结晶体，多为球状(如雨花石)，特别致密，表面研磨后更为细腻，可在硬杂木板上急骤地摩擦十几下，一般真玛瑙不热，木板却发烫；颜色常是多种色彩混杂于一块玛瑙中，形成美丽的花纹、层纹、锦花等绚丽多彩的图案。