初次登陆游戏时，玩家扮演一名训练家，需要选择游戏角色，一开始是人物选择界面（男女性别选择），接着是部分服饰（包括发型、衣服、配饰等）特色的选择。玩家可通过游戏内的训练师与现实世界进行互动。训练师的形象会随着玩家在现实世界的位置变化而在游戏地图上变化。[1][2]
玩家角色到达5级后需要选择所属的阵营，有“红”、“黄”、“蓝”三个阵营（即急冻鸟队伍、闪电鸟队伍以及火焰鸟队伍）。三个阵营属于对立关系，具体体现在“道馆争夺战”。
游戏允许玩家在世界范围进行探索，可收集超百只不同种类的宝可梦，《口袋妖怪GO》的宝可梦主要基于初代《口袋妖怪》游戏。当玩家在野外接近一个宝可梦时，手机就会收到“有宝可梦在附近”的通知，宝可梦在200米范围内可见，玩家使用手机的掉出精灵球将小精灵捕获。它们会分布许多有趣的地方（世界各地名胜古迹、著名景点），比如艺术馆、历史古迹、纪念碑等。
而宝可梦主要是根据自身属性分布在世界各地，比如水栖宝可梦水箭龟这种会在大海旁边或者沙滩上、喷火龙这种可能会在靠近赤道的地区出现，特定的宝可梦会在独特的地点生活。但是，稀有宝可梦只会在世界上少数地点出现。
开发者保证宝可梦不会放在那些人们无法到达的地方，如火山内部或北极等。同样，一些危险之处（十字路交叉口）也不会有宝可梦出没。因此这些宝可梦的栖息之地将是玩家可以方便到达的任何地方，包括未来稀有宝可梦也同样如此。捕捉方法
捕捉宝可梦主要通过：点击精灵球-扔出去-捕捉小精灵。捕捉时，宝可梦会出现闪躲来躲避玩家对其的捕捉，对其投喂红蔓莓可以降低宝可梦的捕捉难度，宝可梦的头上会显示一个圆圈，总共有红色、橙色、绿色三种颜色，这显示宝可梦的捕捉难度，绿色难度最低，红色则最高。捕捉后便作为角色的宠物，作为角色的战斗单位，玩家可以对该宠物进行命名。可以投入到道馆中战斗。属性和正统《口袋妖怪》系列游戏一致的是，每只宝可梦都有着自己的独特数值，包括身高、体重和战斗力（CP），宝可梦的基础属性是血量（HP），不同玩家在同一地点捕捉到的同一只宝可梦，也会有各自微妙的差异。宝可梦的健康程度是通过HP来测量的。一个精灵的血量变成0会晕倒（进入濒死状态），需要使用更生剂（Revive）或者特级更生剂（Max Revive）来恢复。