对消化系统的作用：能迅速被胃肠壁细胞直接吸收，激活胃肠功能，促进消化酶的分泌，增进食欲，调理慢性胃肠病患。
对循环系统的作用：降低血粘，清除低密度脂蛋白，防止动脉硬化，增强心肌和血管的弹性，有效调理心脑血管疾病。
对呼吸系统的作用：激活肺部细胞，修正气血屏障，清除肺部毒素，预防和调理肺气肿、肺供氧不足等呼吸系统疾病。
对骨骼系统的作用：促进生成大量的成骨细胞，抑制破骨细胞，调理骨质疏松、股骨头坏死、关节炎和钙缺乏导致的疾病。
对神经系统的作用：激活神经系统功能，促进脑细胞树突的生成，逆转脑萎缩，加强深度睡眠。预防和调理记忆力减退、神经性头疼、神经衰弱、老年痴呆症等。
对内分泌系统的作用：逆转内分泌器官的退化，促进荷尔蒙和各种酶的正常分泌，增加肾功能和性器官的发育，预防和调理糖尿病等内分泌疾病。
对免疫系统的作用：刺激胸腺再生，加快淋巴T细胞、B细胞和NK细胞的生成，增强吞噬细胞吞噬病毒病菌和癌细胞的能力，提高免疫功能，预防肿瘤和癌症。
人体是由细胞构成的，细胞是由水、蛋白质、脂肪类、糖类和矿物质五大物质构成，其中水占85%—90%，蛋白质占7%—10%，脂肪类占1%—2%，糖类占1%—1.5%，矿物质占1%—1.5。因此，除去绝大部分的水，蛋白质就是组成人体最重要的物质。过去医学界认为氨基酸直接构成了蛋白质，但是经过对肽的研究发现，氨基酸不能直接构成蛋白质，而必须互相结合形成肽链，再由肽链经过折叠盘曲形成蛋白质。人体补充三九蛋白肽就是在补充小分子活性肽，其对免疫功能低下、免疫功能退化、免疫功能障碍，能迅速起到增强、激活和修复其免疫功能的作用。在免疫系统受到攻击、侵袭的情况下，可起到抵御、保护作用，有效地提高人体抗病毒、抗细菌侵袭的能力。肽是构成人体一切细胞的基本材料，一切人体的肌肉组织和结缔组织、促进体内生化反映的酸，调节生理的激素，运输氧或其他离子的载体，抗拒病菌的抗体等都是肽，如肌肉、头发、胃蛋白酸、血红蛋白等都是由肽构成的。所以我们全身都是肽，另外细胞的更新、代谢、生长、修复都离不开肽，肽是生命存在的形式，没有肽，细胞就没有活性；没有肽，器官就没有活力。