有的鲶鱼养在污水塘里，喂的是以动物性食物为主的饲料，这种鲶鱼的腥味不仅仅是泥腥味，还夹杂着腐腥味，光是近距离闻着都能感觉到浓腥味，只靠表面清洗是无法彻底洗去的。因此，如果不急着食用的话，买回来的活体鲶鱼可以先用清水养几天，不要喂食，每天换水两三次，这样一来可以大大减轻腥臭味，二来可以让鲶鱼消耗掉一部分自身的脂肪（这一类鲶鱼往往满肚肥油，连皮下都是一层脂肪），食用时不会那么油腻。
对于上文所述污水环境下养殖的鲶鱼，如果可以撇开人道主义不考虑，到在清水养了一段时间后，准备宰杀钱可以采用放血的方法进一步减轻腥味；同时，那种环境下的鲶鱼，往往富集了不少重金属和二噁英之类的有毒致癌有机物，这些污染物有一大部分存在于血液里，因此，可以通过放血去掉一部分污染物。具体做法是：在活体鲶鱼身体两侧划深及脊柱的刀痕（不要切断脊柱，不要伤及内脏，防止鲶鱼过快死亡），然后把鲶鱼放到盐水里游动，让鲶鱼不断挣扎流血。
对于从鱼摊或是超市等已经宰杀好的鲶鱼，买回来后不需要自己宰杀，卖主原先也清洗过了，但卖家往往清洗质量不好，最好还是自己再清洗一次，用料酒或是白酒兑水清洗一下，可以有效去腥，也可以去除没清干净的泥污。
鲶鱼体表有一层黏糊糊的胶质，这种胶质往往带有泥腥味，因此，最好去掉这些胶质再烹饪。宰杀活鱼之前，可以在鲶鱼放在浓盐水（少量）里挣扎，或是不放水而只在体表撒盐，让其挣扎，半小时后再宰杀，这样就能去掉不少胶质。
食盐并不一定能彻底去除鲶鱼身上的粘质，只要鲶鱼还活着，体表就会不断产生粘质。因此，鲶鱼在杀死后，再用面粉或是淀粉擦洗一遍，如果再不彻底去除胶质，可以再用菜刀刮一遍，这样就能彻底去除了。
鲶鱼的腮一定要完全去掉，体腔内的淤血也要彻底清除，体腔内的黑膜和脂肪也要剔除，这些物质都是有腥味的，如果去除彻底，影响口味和食欲。