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未填开付款方全称的发票：主要包括未填写、填写错误或者填写简称等情形，其中填写简称情形的尤为突出。付款方全称应当与企业营业执照上的名称一致，不能用简称代替，如果企业名称确实太长，超过税控机可以现实的字数，可以向当地主管税务机关申请备案规范的简称。
变更品名的发票：比如购买的是职工福利卡，发票品名填写办公用品，是属于不正常的，而且违法，这种发票审核起来比较困难，单纯从发票票面是无法鉴别出来的，须结合实际情况处理。
假发票：发票本身就是假的，目前辨别发票真伪的方法很多，一般是直接到发票查验平台查询，在一些报销软件中，如报销吧，已具有发票鉴伪功能，扫描电子发票/增值税发票二维码可以自动验真、名称及纳税人识别号。
发票专用章不合规发票：自2011年2月1日起，所有的发票必须加盖发票专用章，不再加盖财务专用章，企业在审核发票时，应当关注是否加盖了发票专用章，以及章的样式是否合规。经常有纳税人遇到这样的情形：开票人在盖章时没有盖清楚，然后在旁边重新加盖一次印章。这是不允许的，如果盖章不清楚或者盖章错误，应该直接退回发票要求对方重新开具并加盖正确的发票专用章。
涂改票面信息发票：发票付款方名称中一个字填写错误，开票人提出可与在此处修正并加盖发票专用章，其实这种方式是不可取的。按照规定，如果发票项目在填写过程中出现填开错误的情形，应当作废并重新开具发票，不得手工涂改发票信息，不得手工涂改发票信息，存在此情形的，售票方有权拒收并要求对方重新开具发票。
机打发票采用手工开具的：有个别时候会出现开票方以开票故障为由，不开发票或者直接手工开具发票，直接手工开具发票是不可取的，不能用于报销凭证。对于此类情况，应事先过问对方能够开具发票，以防后面对方找借口。
自行打印专票销货清单的：全面营改增以后，增值税专用发票的地位越来越重要，企业存在大批量采购货物、服务的行为也经常发生，有的企业在开票时可能会开具“货物一批”，然后附一份自行打印的销售清单。这样的专票也不合规，纳税人一定要要求开票方开具税控系统开具的销货清单才可以。