科研人员做的western blot实验一般需要对其结果扫描后进行灰度分析,一般使用的软件为Image J,今天我们就来学习意下如何用Image J分析WB的实验结果。
工具/原料
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Image J
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Western blot的扫描图片
方法/步骤
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2、完成步骤1后,装好Image J软件后,点击软件上方的File,下拉点击Open,将扫描图片拉入进入软件中。接着点击软件上方的Image,下拉第一个是Type,点击,将其改为8-bit。
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3、点击analyze,下拉点击set measurement,点击图中所勾的四个选项。然后点击ok确定。然后点击process,下拉点击substract background,只勾图中light background一个选项,点击ok即可。
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4、完成第三步后,点击analyze,下拉出现set scale,点击它,弹出一个小框,把unit of length 那个空白框内的英语改为pixels,点击OK即可。
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5、完成前四步后开始点击file下方一些列不规则圆圈,选择心型圆圈,点击出现freehand selections。然后点击Edit,下拉出现invert,点击即可。
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6、最后一步,进行灰度统计。用鼠标选择图中亮色区域,尽可能的把亮色区域全部圈起来。然后点击anlyze下拉出现的measurement,即可弹出你选定区域的灰度统计值。
注意事项
选择freehand,尽可能的将亮色区域圈起来,圈的范围不能太大,要比较精准,不然误差会很大。