转速可以达到13,000 rpm的传统台式离心机
乙醇,氯仿,一次性注射器,研钵
RNAmisi microRNA快速提取试剂盒1个
动物组织(例如鼠肝脑)a. 新鲜组织用解剖刀迅速切成小碎块,根据处理组织的质量,按照50-100mg加入1ml的比例加入Lysis/Binding buffer后电动或者手动彻底匀浆。或者在液氮中研磨组织成细粉后,取适量组织细粉(约50-100mg)转入装有1ml Lysis/Binding buffer的1.5ml离心管中,剧烈吹打涡旋混匀。b. 可选,一般不需要:如果处理量大,有明显颗粒或者不溶物,非常粘稠或者裂解不充分, 可立即用带针头的一次性 5 ml(约0.9mm针头) 注射器抽打裂解物 10 次或直到得到满意匀浆结果(或者电动匀浆30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高产量。接操作步骤项下3。
室温放置5分钟以充分分离核酸蛋白复合物。
加入200μl 氯仿,剧烈振荡15秒。
室温放置2-3分钟,13,000rpm离心10分钟。
小心取上清(约600μl)转入到新的离心管,加入1.5倍体积的无水乙醇(必须是室温的,通常900μl),涡旋混匀。此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心,立刻接下步。
将混合物(每次小于700μl,多可以分两次加入)加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)12,000 rpm离心30-60秒,弃掉废液。
加700μl Wash Solution 1(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。
加入500μl Wash Solution 2/3(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。加入500μl Wash Solution 2/3,重复一遍。
将吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
取出吸附柱RA,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50μl RNase free water(事先在 100℃水浴中预热效果更好), 室温放置1分钟,12,000 rpm 离心1分钟。
如果预期RNA产量>30μg,加30-50μl RNase free water重复步骤11, 合并两次洗脱液,或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍(如果需要RNA浓度高)。洗脱两遍的RNA洗脱液浓度高, 分两次洗脱合并洗脱液的RNA产量比前者高1 5–30%, 但是浓度要低,用户根据需要选择。
附:microRNA富集方法(仅仅提取microRNA,不包含>200 nt其它总RNA成份。)1. 按照前面标准操作步骤1-5操作,直到得到上清。2. 较精确估计上清体积(约600μl),加入等体积70%乙醇(请先检查是否已加入无水乙醇!)(必须是室温的),涡旋或者吹打充分混匀,不要离心。3. 将混合物加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)12,000 rpm离心30-60秒,收集滤过物。将滤过物从收集管转移到一个新的离心管后,把吸附柱子放回空的收集管内,再加入剩下的混合物,离心,收集滤过物。合并两次滤过物,计算体积。此时,滤过物含有microRNA, 吸附柱子上面是除去了microRNA的总RNA(不包含microRNA),如果需要,可以按照前面标准操作步骤8-11操作漂洗,洗脱回收得到去除了microRNA的总RNA。4. 较精确估计滤过物体积,加入0.65倍体积无水乙醇(必须是室温的),涡旋或者吹打充分混匀,不要离心。5. 取一套新的microRNA吸附柱MA,将上一步骤混合物(每次小于700μl,多可以分两次加入)加入microRNA吸附柱MA中,(吸附柱放入收集管中)12,000 rpm离心30秒,弃掉废液。6. 按照前面标准操作步骤8-11操作漂洗,洗脱得到富集的microRNA。注意:不同的实验可以选择不同的方法,例如Northern Blot或者表达芯片谱分析可以选择提取包括microRNA的总RNA。富集方法提取的microRNA因为去除了较大片段的mRNA和rRNA等,可能减少某些下游试验的扩增背景,当背景较高或者非特异扩增较多时,可以尝试使用富集方法提取的microRNA。
Wash Solution 1和Wash Solution 2/3加入无水乙醇后,可以在常温保存。
Wash Solution 2/3可能加入乙醇使用几天后出现沉淀晶体,并不影响使用,直接不吸晶体,吸上清使用就可以。
运输在常温下进行,不影响使用效果。
避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。