psRNATarget: A Plant Small RNA Target Analysis Server 是一个植物miRNA靶基因预测网站,可以通过这个在线系统进行靶基因的预测,现在分享一下。
工具/原料
电脑一台(联网)
方法/步骤
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百度搜索“psRNATarget: A Plant Small RNA Target Analysis Server ”,第一个搜索结果单击击进入,如下界面。
2
文本框内可以输入你要匹配的miRNA序列。
3
选择该序列所属物种对应的数据库,比如该miRNA序列为玉米的miRNA,则可选择玉米的库。
4
参数设置可以选择默认,也可以根据自己的需要进行设置,每个参数之前都有相应的说明。然后点击“Submit”。
5
之后系统开始运行。
6
如图,结果出来之后,Expectation (E)为期望值,一般是从小到大排列,期望值越小可信度越高。Target Accessibility 为允许的最大能量解除配对目标位点,值越小越好。选择自己需要的基因即可。
注意事项
有问题可交流
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