在杰佛逊纪念馆里有一台超极庞大的净水机，然而启动他之前还缺些零件 于是我们根据老爸留的线索来到112避难所找老爸
这里又要进入模拟仓了 老爸说当年搞净水计划的神人，把秘密隐藏在拟虚实境里，所以我得亲自进去系统里面查看
进入虚境后就刺激了，因为不解谜是跑不出来的，会困死在虚境里 和所有人对话，其中有个老太太说她觉得怪怪的，她好像有看出这不是真实的世界 于是听她的指示到一个叫废弃屋的建物里 有顺序的按出音符就解谜了就好像骇客任物那样破解母体的假象
靠靠～ 见到老爸了耶 父女俩终于团员了，接着要回到航空母舰 由于本人经历过外星人的洗礼，自然成为荒原上最强保镖一路维护老爸安全...
回到舰上后大家准备一起出发到杰佛逊净水厂
老爸叫我去修水管的时侯竟然被大批英克雷军包围了 那上校口气很不好一直叫老爸把所有科技交出来 老爸说我们只是民间团体，只想把所有被核污染的水净化给大家干净的喝就好 但上校就是听不进去
老爸死前按下警报 该里面的人全死掉，并叫我快逃！ 李博士只好带着剩下几位帮忙的助手跑来钢铁兄弟会求救
接着我们得先锁定87号避难所的位置才有办法去取得老爸交待的关键零件...
来到87掩体的外围被一群小孩守着，你可以冷血清光他们 也可以先帮他们到一个叫失落天堂(PARADISE FALL)的地方救出他的同伴
总之最后获得进入87掩体的门
这个恐怖的鬼地方，可是当年FEV生化病毒的实验室哩... 里面一堆骇人惊心的画面
这里会遇到全GAME最强同伴，号称42万滴血的FAWKES 先救了他他会帮主角去一个充满强烈核辐的地区拿出GECK这个配备 那地方除非开挂不然进去没几秒就死了
一离开87掩体，又中埋伏，又是杀老爸的该死英克雷上校 这次我被他抓了 (靠靠，他不是死在净水厂了? 怎又出现了，真是见鬼了)
他问你净水机的密码，如果你老实讲出来那就GAME OVER 了 所以读档重选，乱说一组号码给他 密码就是你出身时，老妈留给你那个我是阿尔法我是.....(圣经的章节数字当密码) 接着就杀出英克雷基地啰
一路清英克雷兵，来到台大电脑前，里面好像是他们首领，一位叫EDEN的总统 可是我嘴炮无敌(口才100) 选择说服他自爆，把基地的给毁了... 而竟然说服成功 ！
靠靠！整个基地真的炸掉了～有些小部队则逃了山去其他全死在里面.. 图里的变种人是在87避难所遇到的同伴他说他看到我被绑来此就尾随来救我 真是非常感人说...