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TRAF基因和TAK基因的克隆方法

最近小编收到很多问题,其中一个就是下面小编为大家整理一下关于TRAF基因和TAK基因的克隆方法的步骤,希望这些方法能够帮助到大家。
方法/步骤
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首先,在根据GenBank中已提交的鱼类TRAF6 和TAKI cDNA序列的保守区设计兼并引物(TRAF6-F/TRAF6 R; TAKI- F/TAK1-R)。

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然后,扩增TRAF6和TAKI基因的核心片段。PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测后,与PMD18-T (TaKaRa, Japan)载体连接,转人trans5a感受态细胞中,筛选阳性克隆进行测序。

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然后,通过BLAST 比对分析后获得TRAF6和TAKI基因的核心片段,根据得到的核心片段设计RACE特异性引物(表1),利用巢式PCR扩增TRAF6和TAKI基因的5'和3'末端。

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然后,在电泳检测目的片段后,连接到载体,转化trans5a感受态细胞,筛选阳性克隆送测序。BLAST分析测序结果,Seqman软件拼接得到的序列,最终获得半滑舌鳎TRAF6和TAKI基因全序列。

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然后,进行序列比对和系统进化分析,利用EditSeq软件预测TRAF6和TAKI基因的开放阅读框(ORF)及可能编码的氨基酸序列。

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最后,预测和分析蛋白结构城,在NCBI数据库中搜寻其他物种的TRAF6和TAKI的氨基酸序列,利用MEGAS.O软件,以Neighbor jining法构建系统进化树。

注意事项

上述方法为小编整理所得,希望能够帮助到大家。

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