在正式抽取羊水之前，先帮孕妇做超音波检查，决定胎儿大小、怀孕周数、胎儿位置及胎儿数目。
找出最适合下针的位置，为孕妇消毒皮肤。
在孕妇的肚皮上铺上无菌单，以20或22号脊椎穿刺针在超音波的引导下，逐步刺入之前选定好的羊膜腔内。
确定脊椎穿刺针已在羊膜腔内，开始以负压将羊水抽出，前面2毫升的羊水必须丢弃(怕引起母源细胞污染)。
大约抽出20毫升的羊水，将穿刺针的内管置回。
回抽整支穿刺针，在肚皮的针孔上贴上绷带请孕妇在羊水检查室外稍坐休息10分钟，若无不适就可以回家了。
羊膜腔穿刺术是一种产前诊断技术，其操作是有创性检查，因此存在以下医疗风险1、该操作用细针穿刺进入羊膜腔，可能造成孕妇出血、出血性休克、羊水外流、流产及伤及胎儿的可能2、因子宫畸形、胎盘位于前壁、腹壁太厚、羊水过少等原因可能导致穿刺失败。3、由于羊水细胞培养系脱落细胞体外培养受羊穿时间、标本是否混血、培养基污染等多种因素影响，羊水培养有失败的可能，有时因为崁合体而不能诊断。4、受现有医学技术水平的限制，羊水生化检查、细胞学、和分子遗传学分析有时难以确诊，需进行进一步检查5、如术前孕妇存在隐形感染或术后卫生条件不佳，有发生宫内感染的可能6、孕妇若合并心脑血管疾病，由于疼痛、紧张等刺激，有发生心脑血管意外的可能7、通过本次检查，可以排除拟诊断染色体异常的疾病，但受现有医学技术水平的限制，有时难以分辨染色体的某些微小异常，也不能排除一些多基因病、或其他原因导致的胎儿畸形或异常。8、由于不可抗拒的外界影响如停电、地震或培养设备的损害等非人为因素造成羊水培养失败可能。
如有过敏史，特殊疾病史和其他需要说明的情况，请在术前登记时告知医生。
若术前3～7天有感冒、发热、皮肤感染等异常，请在术前登记时告知医生。
术前三天禁止同房;术前一天请沐浴;术前10分钟请排尽小便。