专利申请书
专利申请材料
准备专利申请文件。从中国向日本申请专利时，日本和中国一样都需要委托该国的专利代理机构。但，日本与中国不同的是，在申请之时，并不需要向特许厅提交委托书，只要在申请书中填写代理机构名称就可以。
向日本专利局提交申请。所需要的文件，日本与中国几乎相同，都需要提交权利要求书、说明书（有附图的提交附图）以及摘要。其中与中国最不同的是，日本在提交申请文件时，如果有要求优先权，则在申请之时可以提交外国申请文件（其中，所谓外文只限于英语），并在提交外文申请文件后的两个月内补充日文译文。另外，该外文申请文件，日后可以作为修改的依据（比如，日文译文有错时，可以通过提交误译订正的方式提交补正）。
受理（日本专利局发出受理通知书）
公开（自申请日起18个月，日本专利局公开专利申请文件）
实质审查请求（申请人须在申请日起三年内提出实质审查请求）。
实质审查（日本专利局对专利申请进行实质审查，申请人须对审查意见通知书答辩）。实质审查与中国几乎相同，都是对专利的专利性进行实质审查。
授权与公告（如专利申请符合相关法律要求，日本专利局对该发明创造授予专利权并公告授权专利）。通过实质审查，认定申请的专利具有专利性时，特许厅会发出「特许查定」（授权通知书）。申请人自收到特许查定后的一个月内办理登记，缴纳该年年费，得到专利权。
日本对发明专利实行先申请制、申请公开制和实审请求制；在发明技术已经实施或被侵权的情况下，申请人可要求提前审查；自授权日起6个月内，任何人均可向JPO复审部提出异议；自1994年起，对日本的申请可提交英文版，但自申请日起2个月内须再次提交日文申请；日本设有提前复审制度。发明专利保护期为自申请日起20年。
日本曾对实用新型采用实审制，1994年改为无实审登记制，申请人可要求JPO提供实用新型技术评价书。自2005年4月1日起，实用新型保护期由原自申请日起6年延长为自申请日起10年。
日本对外观设计实行实质审查制(授权后公开)，申请人可要求提前审查。自2005年起，外观设计申请人在发现侵权仿制品后可向JPO提出请求，JPO即对其申请案实行优先审查，并于1个月(普通申请为8个月)内结案。外观设计保护期为自申请日起15年。
日本特许法规定“发明”是指利用自然规律的技术思想的创作中的高水平创作物。按照现行特许法第2条的规定分为产品发明、方法发明、生产产品方法发明三种。发明专利有效期为20年，自专利申请日起计算。农药和医药等专利由于需要药物审查认可等受保护方面的法规的约束而无法实施的情况下，可以基于专利权人的申请，在无法实施的期间（五年）的范围内进行延长。