筛选：体积悬殊的杂质、大小分档、药渣、残留的辅料（用筛或箩。）
风选：质量轻重不同的杂质和非药用部位。（可借用风车等电动工具。）
水选：比重不同的杂质、内外部的泥沙、盐分。（用水洗或漂。）
去根或茎用茎部分的药物，除去主根、支根、须根等非药用部位，如石斛、芦根、藕节等。用根部的药物，除去残茎，如龙胆、丹参、威灵仙、防风。
去皮壳一些药物表皮（栓皮）及果皮、种皮属非药用部位（如桃仁、苦杏仁去皮）故除去；果皮与种子两者作用不同（如白扁豆去皮），须分离；有一定毒副作用的外皮须除去，如白首乌皮、苦楝根皮、雷公藤皮等。
去毛有些药物表面或内部常着生许多绒毛，服后能刺激咽喉引起咳嗽或其他有害作用，故需除去，消除其副作用。 去毛方法根据不同药物也不相同：刮去毛、燎去毛：鹿茸；刷去毛：枇杷叶、石韦等在叶背密生绒毛，多用毛刷刷除；烫去毛：骨碎补、狗脊、马钱子等表面黄棕色绒毛，可用砂炒法将毛烫焦，取出稍凉后再去毛茸；挖去毛：金樱子在果实内部生有淡黄色绒毛，可将果实纵剖两瓣，挖净毛和核；撞去毛：香附表面的黄棕毛，可将香附和瓷片放进竹笼中来回撞去毛。
去心一是除去非药用部位，如牡丹皮、地骨皮、巴戟天、五加皮的木质心不入药用，在产地趁鲜将心除去。二是分离药用部位，如莲子的心（胚芽）清心热，而莲子肉能补脾涩精，故需分别入药。
去芦芦又称芦头，指药物的根茎、叶茎等部位，习惯去芦的药物有人参、党参、玄参、桔梗、地榆、牛膝、续断等。
碾捣一些药物由于质地特殊或形体较小，不便切制，不论生熟，均需碾或捣碎，如自然铜、赭石、龙骨、阳起石、龟甲、牡蛎、瓦楞子、芥子、韭菜子、木鳖子等。
制绒某些药物碾成绒状以缓和药性。如麻黄制绒，发汗作用缓和，适用于老幼体弱者；便于应用，如艾叶制绒，艾条或艾柱，便于制成灸法中所用。
拌衣将药物表面用水湿润，使辅料粘于药物上，以起一定治疗作用，如朱砂拌茯神、茯苓、远志，以增强宁心安神作用；青黛拌灯心草有清热凉肝的作用。