秀丽隐杆线虫做为优秀的模型生物,广泛用于脂代谢,抗衰老,先天免疫,病虫害相互作用等的研究中,对于新手们如何有效获取秀丽隐杆线虫的信息尤为重要,我们以秀丽隐杆线虫数据库为例,介绍数据库Wormbase的使用。
工具/原料
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电脑
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浏览器
方法/步骤
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首先搜索Wormbase数据库。
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在搜索栏下拉选项中有多个可以选择,例如查找基因信息(Gene),查找蛋白信息(Protein),查找线虫株(Strain)等。
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下面我们以胰岛素受体突变株daf-2为例,说明数据库的应用。我们在搜寻栏里输入daf-2,选择(for a gene),搜索,就可以看到这个基因的详细描述。
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同样,我们需要查找某一突变线虫株时,选择(for a strain),搜索,查找时这个基因对应的突变线虫株名。
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当然,我们在查找基因的时候还可以在左侧看到更多的关于这个基因对应的信息,例如基因对应的同源基因(homology),与其它蛋白的相互作用(interactions),基因对应的表型信息(phenotypes)等等。
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最后,如果我们对这个基因很感兴趣想进一步研究,还可以转到最下行,查看这个基因对应的已经发表的文献,以此入手,更快掌握这个基因的信息。
注意事项
由于Wormbase为国外网站,因为网速不佳时常出现网站不能搜索的现象。
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