大部分药物均不可冲入马桶。近年来，研究发现把含有激素、抗生素和其它物质的特定药物冲入马桶，可导致地下水污染及其它有害影响。比起冲入马桶，更安全的处置方法是掩饰药物，然后与其它垃圾一起丢掉。阅读药物包装，查看安全处置的指示。有些药物被认为潜在危害太大，而不可与其它垃圾一同丢弃。如果该药物是受严格控制的物质，若不小心吞食，可导致严重医疗损害。美国食品和药物管理局建议把这类药物冲入马桶，或以另一种方式处置。如果你不确定要丢弃的药物是否属于严格控制的药物，可询问药剂师该怎么做。
将药物与猫砂或咖啡渣混合。把药丸或药水混入一些不受欢迎的物质，比如猫砂或咖啡渣。此举将降低小孩或家中宠物找到并吞食药物的可能性。如果药丸太大或颜色鲜艳，将它们捣碎或溶解，才与其它物质混合。
把混合物放入塑料袋密封。此额外保护层是确保药物不会落入不当的人手中的另一方法。
把塑料袋和其它垃圾一同丢弃。一旦药物彻底被掩盖及密封在塑料袋后，只需把它和其它垃圾一同丢掉。
去掉空药瓶的标签。在你丢弃药瓶前，把标签刮掉，使打印字迹模糊及无法辨认。此措施是为了保护你的身份。
确定药物是否被认为有潜在危险。万能的度娘可以帮上你的忙。如果某人找到并吞食这些药物，他或她可能面对严重的健康后果。
全国各地已逐步建立药品回收长效机制，并设立家庭过期药品回收点。查看你所在社区的药品处置计划。许多社区都有此类计划，你可把未使用的药物交给他们，以便得到安全、正确的处置。联络本地药房，看看他们是否能帮忙处置药物。尽管并非所有地区都有此计划，但中国某些地区均有未使用药物的回收定点，你可把药物交给定点药房，由他们处理过期药物。考虑把未使用的药物捐给第三世界国家。你可在网上搜索进行此类活动的组织。某些国家的急诊室偶尔会收集可使用的器具和药物，以捐到国外。如果你所在的地区有这样的服务，也可考虑此方法。联络本地垃圾处理服务，他们也许有能焚化药物的家庭垃圾处理设施。联络本地医院或医疗中心，看看他们是否能把未使用的药物装入生物危害专用容器里焚烧。香港与台湾的医院均有此选择，病人无需丢弃或把未使用药物冲入马桶。如果你身处中国，可尝试联络医院询问。小心勿把药物卖给不法集团。
如果没有其它选择，那就把药物冲入马桶。如果药物出现在不可丢入垃圾桶名单上，而你没有最直接的处置方法，冲入马桶也许是最佳选择。
大部分药房均能处置回收药物。可联络食品药品监督管理局，查询最近的回收定点。
若你担心隐私，可在处置处方药物前，先去掉旧容器上的保密信息。花一分钟毁去注明药物名称、你的名字、医生名字、处方号码、药房名字及医疗状况的标签。你不会愿意在某人翻找你家垃圾时，让这些信息公诸于众。
有时候药物指示与本文指南有冲突。比如说有些药物附有文件说明不可冲入马桶，建议可把药物冲掉。该药物在处置方面仍没有明确共识。
如果你有未投保的持续性医疗状况，或认为未来也不会受保，可考虑贮藏药物，而非弃置（确定并未过期）。这样你就能未雨绸缪。比如说许多人有未受保的持续性膝盖和背部损伤，就能从这些处方止痛药物中获益。