日式旅馆：这是一种在日本被认为高尚优雅的住宿，房间一般为未隔开的单针态个大房间，地下铺有传统的稻草编的“榻榻咪”草席，大多数日式旅馆有公共浴池，大多数地处温泉胜地，住宿费用一般包括两餐，日式旅馆是体验日本古代高雅的诸侯住宿的最佳选择地，也是最受外国旅客欢迎的旅馆，在日本总共有六万家，其中有1,495家高品位的日式旅馆是日本国际观光旅馆连盟的成员。
西式饭店：日本的各大城市都有许多西式饭店，且大多数是著名的连锁饭店，提供高标准的服务和设施，高品位的西式、日式餐厅，店内的服务员都会讲英语。在日本东京，星级的住宿旅馆，一般带浴室的单人间价格在15000—30000日元，带浴室的双人间25000—45000日元，旅游旺季时候需要预定。
商务旅馆：在日本的所有大中型城市，都有这种温馨始随舒适、经济实惠、干净卫生的商务旅馆，备受出差商人的欢迎。日本商务旅馆一般集中在车站附近，基本是单人房，住宿费用每人5500—10000日元，一般没有双人房或双人床。
公寓：主要集中在体育运动地区、滑雪胜地及山区，每宿的平均费用为不包括膳食时8,000日元，包括膳食时10,000日元。
民办旅店：这是深入了解日本人日常生活的最佳选择地，主要集中在旅游胜地和度假村，服务设施简单，民办旅店通常收费6,500日元，其中包括普通家庭风味的两餐。这里推荐日本最受欢迎的两家民办旅馆，位于东京都新宿区西新宿7-3-10、21山京大厦403室的“MINSHUKU ASSOCIATION OF JAPAN”(日本民宿协会)；以及位于东京都江户川区平井3-11-8，商业酒店东华大厦(Business Hotel Toka) 1楼的“JAPAN MINSHUKU CENTER”(日本民宿中心)。
佛教寺院：日本有不少打破常规的是佛教寺院会接待过夜的旅客，有些寺院更加允许旅客参加打禅，其他的仅为旅客提供房间。
这里很少有住宿酒店会为旅客备好牙刷、牙膏，拖鞋等必备品，旅客需要自己带。去泡温泉的旅客，最好是自带相关用品。