肠道传染病 包括肠炎、痢疾、伤寒、霍乱、甲型肝炎、脊髓灰质炎、以及其它肠道病毒感染等。防治对策：加强饮水消毒，爆发疫情时应加大消毒剂的用量；切实管理好粪便，避免污染水源；病人粪便要消毒；管好饮食卫生，不吃腐烂变质的食物。
钩端螺旋体病 钩端螺旋体病是一种自然疫源性疾病，主要的传染源是鼠类、家畜(猪、牛)、以及人。病原体是钩端螺旋体。 临床表现：发烧、畏寒、头痛、全身疼痛、全身衰弱、腓肠肌痛、眼结膜充血、鼻出血等。 防治对策：灭鼠、管好家畜，病人排泄物消毒，疫区高危人群和进入疫区工作的人群接种钩端螺旋体菌苗，个人保护方法如预防皮肤刺伤、减少接触疫水等。
流行性出血热 是一种自然疫源性疾病，病原体是病毒，传染源是黑线姬鼠，传播途径可能是皮肤接触或虫媒传播。 临床表现：起病急，发热38℃以上，全身酸痛，面、颈、胸部充血潮红，结膜充血、水肿，有点状或片状出血，上腭黏膜呈网状充血，点状出血。典型病程有发热期、低血压期、少尿期、多尿期、恢复期。 防治对策：灭鼠是关键，还要防鼠，在劳动、休息、居住的地方避免鼠接触人，同时要杀灭虫螨。
疟疾 国内外因水灾导致的疟疾爆发流行的事件很多，1931年长江、淮河大水，部分地区发病率高达60%。1953年湖北水灾，疟疾发病率增加，并出现爆发流行，例如襄阳县发病率即达38.7%。 防治对策：下大力量消灭蚊虫；填埋积水坑洼消灭蚊虫孳生条件；治疗疟疾病人，包括疟疾休止期有疟疾史的人服药；无病的健康人在流行时预防性服药。
霉麦中毒症 水灾时期正值麦收季节，连绵阴雨致使新麦不能充分晒干，霉菌大量生长繁殖，人食后引起霉菌感染、变态反应、和毒素中毒。 临床表现：以胃肠道症状为主，食用霉麦后30分钟至3-4小时发病，症状为头晕、恶心、呕吐、腹痛、腹泻、不适、无力等。预后良好，无死亡病例。 防治对策：霉麦去霉的方法用风选、泥浆浮选、清水或石灰水浸泡漂洗、剥皮磨粉等。