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骨组织RNA提取方法及步骤

适用于快速提取骨组织细胞总RNA,使用独有基因组DNA清除柱技术可有效清除电泳可见gDNA残留,RNA可用于反转录PCR,荧光定量PCR等。骨组织坚硬、骨细胞密度低、而且外周基质含有大量黏蛋白(蛋白多糖)和RNA难以分离,无法用传统Trizol法进行高质量提取。本方法采用独有的不含苯酚/氯仿配方的裂解液,并添加多种成分去除骨组织蛋白多糖。同时独特基因组DNA清除柱技术可以有效清除gDNA残留,得到的RNA一般不需要DNase消化,可用于反转录PCR、荧光定量PCR等实验。独特的裂解液迅速裂解细胞和灭活细胞RNA酶, 离心沉淀去除多糖和次级代谢产物,然后裂解混合物用乙醇调节RNA结合吸附到基因组DNA清除柱,然后RNA被选择性洗脱滤过, 吸附在基因组DNA清除柱上的残留DNA无法洗脱连同柱子一起丢弃从而清除掉DNA。滤过的RNA用乙醇调节结合条件后,RNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的RNase free H20将纯净RNA从硅基质膜上洗脱。
工具/原料
1

乙醇,研钵或者其它合适的破碎骨组织装置

2

EASYspin Plus骨组织RNA快速提取试剂盒

3

转速可以达到13,000 rpm的传统台式离心机

方法/步骤
1

第一次使用前请先在漂洗液RW瓶加入指定量无水乙醇!取1ml裂解液 CLB至离心管内(如果CLB有析出或者沉淀需先置于65°C水浴重新溶解),在裂解液CLB中加入100μl PLANTaid,颠倒混匀后65°C水浴中预热。多个样品按照比例放大准备。液氮研磨法:a.  骨钳夹碎骨组织后放入研钵(研钵在180度干烤2小时),加入液氮后反复研磨成细粉,注意液氮蒸发后不断补加保存液氮一直存在。b.  转移100mg细粉加至预热的裂解液CLB(已加有PLANTaid)离心管中。立即剧烈涡旋30-60秒或者用吸头吹打混匀裂解直得到满意匀浆结果(或者电动匀浆30秒),可以剪切DNA,降低粘稠度和提高产量。c.  立刻接操作步骤的步骤3。

2

其它骨组织破碎方法:a.  取100mg骨组织加入1ml预热的裂解液CLB(已加有PLANTaid)高速均质仪粉碎匀浆。或者取100mg液氮冷冻包埋切片粉碎的骨头加入裂解液CLB(已加有PLANTaid)粉碎匀浆。 b.  立刻接操作步骤的步骤3。

3

短时放回 65°C水浴中(10 min),中间偶尔颠倒1-2次帮助裂解。

4

将裂解物4°C 13,000 rpm离心10分钟,沉淀不能裂解的碎片。

5

取裂解物上清(在不超过基因组DNA清除柱能力的情况下可以取更多的上清,这样可以提高产量)转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇(0.5体积),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。若上清表面有漂浮物,用吸头挑开吸取下面液体即可。

6

将混合物(每次小于720μl,多可以分两次加入)加入一个基因组清除柱中,(清除柱放入收集管中)13,000 rpm离心2分钟,弃掉废液。确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。

7

将基因组DNA清除柱子放在一个干净2ml离心管内(不用RNAse free 或者DEPC处理,一般干净的新离心管即可。也可使用RNA吸附柱配套的新的干净收集管),在基因组清除柱内加500μl裂解液RLT Plus,13,000 rpm离心30秒, 收集滤液(RNA在滤液中),用微量移液器较精确估计滤过液体积(通常为450-500μl左右,滤过时候损失体积应该减去),加入0.5倍体积的无水乙醇,此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。

8

立刻将混合物(每次小于720μl,多可以分两次加入)加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm离心2分钟,弃掉废液。确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。

9

加700μl 去蛋白液RW1,室温放置1分钟,13,000rpm 离心30秒,弃掉废液。

10

加入500μl漂洗液RW(请先检查是否已加入无水乙醇!),13,000 rpm 离心30秒,弃掉废液。加入500μl漂洗液RW,重复一遍。

11

将吸附柱RA放回空收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

12

取出吸附柱RA,放入一个RNase free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50μl RNase free water(事先在 70-90℃水浴中加热可提高产量), 室温放置1分钟,12,000 rpm 离心1分钟。

13

如果预期RNA产量>30μg,加30-50μl RNase free water重复步骤12,合并两次洗液,或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍(如果需要RNA浓度高)。洗脱两遍的RNA洗脱液浓度高,分两次洗脱合并洗脱液的RNA产量比前者高15–30%,但是浓度要低,用户根据需要选择。

注意事项
1

不合适的储存于低温(4℃或者-20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室温下(15℃-25℃)进行。

2

避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

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