1.常规鱼类 指草、青、鲤、鲫、鳊、鲢、鳙等鱼。鱼苗可用尼龙袋充氧运输，一般每袋装鱼苗8万～10万尾，或用大水缸装运，每立方米水装鱼苗20万～30万尾，也可用活水船放置网箱装运。夏花和鱼种可人工挑运，或用活水船、帆布桶和尼龙袋充氧装运，运输密度根据鱼的种类、规格、水温、水质、运输方式和供气设备综合确定，一般每立方米水装夏花2万～4万尾或装鱼种0.6万～1.2万尾。亲鱼最好用活水船、活水车麻醉运输。麻醉运输可用(13～15)×10-6的巴比妥钠处理运输用水，短距离运输可用棉球蘸少量乙醚塞入鱼口。
2.名贵鱼类 指鳜鱼、黄颡鱼、大口鲶等，这些鱼易缺氧、性凶猛，身体布有硬刺、尖棘，价格又贵，往往运输距离较远，运输时应十分小心。鱼苗和夏花运输可用双层尼龙袋充氧车运或船运，每袋可装鱼苗1万尾左右，或2厘米～3厘米的夏花鱼种400尾～500尾，也可用帆布桶或用特制的铁皮桶装鱼，并配有增氧装置，水和鱼的重量比以10∶1为宜。亲鱼运输宜在冬季水温低时进行，可用布夹夹住单条鱼，以减少鱼体损伤，也可麻醉运输，常用麻醉剂有(10～20)×10-6的奎那啶、0.1%～0.4%的乌来提和(13～15)×10-6的巴比妥钠。
3.虾类 指青虾、南美白对虾、罗氏沼虾等，虾类不耐低氧，运输时对溶氧的要求较高。虾苗常用尼龙袋充氧装运，运程为1小时～2小时每升水装苗7000尾;运程2小时以上12小时以内装苗5000尾;运程12小时以上24小时以内装苗3000尾。也可用木桶、帆布桶带氧气瓶充氧装苗，装苗密度每升水500尾～700尾。亲虾装运宜用活水船或车运，如用汽车运输，应有充气装置，也可用帆布桶或铁皮箱装水充气运输，每升水可装亲虾200克左右。
4.河蟹 装运蟹苗(也称大眼幼体)大都用蟹苗箱，运输前对蟹苗箱等工具要洗净、消毒、暴晒，箱体用清水吃透水分，箱底铺一层洗净、浸湿的新鲜水草后将苗轻撒在箱内，每箱可盛苗1千克左右，运输途中要防冻、防高温、防颠簸、防止直接吹风，同时要适当保湿。蟹种(又称“豆蟹”“扣蟹”)及亲蟹运输比较方便，可用密眼网袋、蒲包、蟹篓等器具运输，运输途中器具应平放，防止堆、压、挤，运前要让蟹鳃吸足水，运输途中要保持一定的温度和湿度，避开日晒和风雨，避免温差过大。