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如何进行mRNA引物比对?

我们在引物合成前必须进行引物对比,确保其特异性良好;若特异性不好就只能重新找引物了。
工具/原料

引物序列

genebank引物比对攻略
1

在ncbi主页中,点击【blast】;

2

点击【primer-blast】,进入引物对比界面;

3

进入引物对比界面,我们在【Primer Parameters】输入要查询的引物序列;

4

我们在【Primer Parameters】输入MMP2的序列,AGTTTCCATTCCGCTTCCAG;CGGTCGTAGTCCTCAGTGGT ;

5

在Organism中,选择【Homo sapiens】;

6

点击【get primer】进行引物比对;

7

查看引物比对结果,找出自己查询引物的特异性怎么样。

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