在生物学的研究中,有一个常用的方法,就是通过比较分析获取有用的信息和知识。想当年,达尔文爷爷正是研究比较了达尔文雀(galapagos finches)同其它一些物种的形态学特征,从而提出了自然选择学说。在科技飞速发展的今天,对两个物种进行全基因组序列比较已经不再是一个梦想。达尔文爷爷泉下有知,一定会喜极而泣!介绍如何使用DNAMAN 8作核酸多序列比对。
工具/原料
1
电脑
2
软件 DNAMAN
方法/步骤
1
下载好 DNAMAN 8 的软件并打开
方法/步骤2
1
将所需比对的序列保存好以后,选中Sequence—Aligment—Multiple aligment sequence进行多序列比较。
2
在弹出的窗口Sequence&Files中加载序列,File、Fold、channel、Database分别表示从文件、文件夹、channel和数据库中获取序列。勾选窗口中的“DNA”,点击“下一步”。
3
在弹出的窗口Method中,“optimalaligment”最佳比对方式中有四个高大上的选项:Full Alignment(完全比对)、 Prosile Aligment(轮廓比对)、 New Swquence on Profile (轮廓上的新序列)、Fast Alignment(快速比对),本文选择了Fast Alignment,并且勾选了Try both strands(尝试使用双链)。其他项目不需修改,默认就OK,点击“下一步”。
4
“Duang”,结果就出来啦!点击“Option”可以选择要显示的内容。
方法/步骤3
1
保存:点击File-output-Graphic(EMF)File,该序列比对的结果窗口可以图片格式保存。
2
做 进化树 分析并保存 !!完成啦
上一篇:雅斯兰黛小棕瓶精华怎么用