灰指甲的传统治疗方法是在用药前用小刀刮削松脆的病甲，或将病甲削薄，然后涂5%碘酊或10-30%冰醋酸溶液。这种方法起码要坚持一年才能见效。很多病人往往由于碘的颜色，冰醋酸的气味以及疗程太长而中断治疗。而且指(趾)甲自身的致密结构阻碍了外用药物的渗入，因此单用外用药治愈率较低，目前主要配合口服药使用。
手术拔甲的治疗虽然方法简单，但由于有时很难彻底清除病甲，并且仍然存在甲床中的真菌再次侵入甲板的机会，复发较多且术后造成的剧痛和可能引起的继发感染给生活和工作都带来诸多不便，目前极少采用。
后来医学界研究开发了口服抗真菌药物，早期的有灰黄霉素、酮康唑。这些药物服用方便，但因疗效不稳定、抗菌范围小，复发率较高且有令人担心的副作用，加之服药时间长达半年到一年半以上而渐被淘汰。
近几年，新一代的口服抗真菌药的出现，使灰指甲的治疗获得了很大的突破，可以说，只要积极治疗，灰指甲是完全可以治愈的。
灰指甲在家庭内的广泛传播主要是由于患者对疾病不重视，没有及时寻求并坚持正确治疗以及家庭内不良的卫生习惯造成的。当家人患有灰指甲，若不及时发现和治疗，病变的指(趾)甲就象一个真菌的仓库，不断向外散布病原菌。如果不经常洗脚，这些皮屑就会与汗和灰尘等混杂起来积蓄在脚趾缝里，这里温暖、潮湿且营养丰富，是真菌理想的生活乐园。积蓄的真菌再通过家庭内共用的盆、毛巾、拖鞋、指甲剪等物品，传染给密切接触的父母、配偶、子女，其中抵抗力较弱的老人和孩子很容易成为受害者。
那么如何避免在家庭内被真菌传染呢? 1)保持全家人的足部清洁、凉爽和干燥; 2)尽量用淋浴方式，避免使用碱性肥皂; 3)不穿不透气的鞋; 4)不光脚走在地毯、浴室地板上; 5)避免环境潮湿阴暗; 6)不和患病家人共用盆,毛巾、鞋袜、指甲刀等用品; 7)保持指(趾)甲的正常长度，不要剪得太短，也不要留下角刺; 8)不要用同一把指甲刀去修剪正常甲和异常甲; 9)脚底、趾间痒尽量不要用手抓; 10)定期对家庭环境及患者用品进行消毒等。