自洁、除臭、省电。 智能马桶盖多采用不锈钢喷头，以恒洁卫浴专业品牌的智能马桶为例，推出了具有自洁功用的商品，即在每次运用完了后，喷头会放射出瀑布式的水流，迅速清理沾染的污垢。它的智能马桶盖兼具除臭功用，其原理是应用座便盖中内置的光触媒或活性炭等来消除异味。另外，在临时不运用时，马桶盖会自动降低座圈及水温，节省电能耗费。
座圈不冰冷。冰冷时节，马桶座圈冰凉的触感让人毛骨悚然，而智能马桶盖的座圈可以自动加热到人体适合的温度。恒洁卫浴产品都具备了温控座圈，拥有不同温度档式，依据个人爱好或地域和天气来调整调理，再也不必惧怕如厕时的冰冷感觉了。
水洗更卫生。每次如厕后，智能马桶盖的水洗功能替代手纸清洁，更易消灭引发传染性疾病的病毒、细菌、真菌或寄生虫，具有多种冲洗形式。智能座便盖不但能无效去除污物，还能起到按摩作用。前后可挪动式的喷头，可以满足男性、女性的不同冲洗需求。运用智能座便盖的温水和暖风做清洗和烘干，安慰毛细血管促进血液循环，长期运用还可预防便秘、痔疮等疾病。
部分品牌和型号老人、儿童难操作。 智能马桶盖的一侧往往配有一个按钮或单一的操作面板，或是配有一个按钮更单一的遥控器。这就无疑为老人、 儿童添加了操作难度。假如误操作，也许无法顺利到达喷水、加热、除臭等效果，甚至还能够形成商品自身电路毛病。不过新型马桶已经升级为自动感应功能，比如恒洁智能马桶的一键智简功能，无需太多操作，就比较适合老人和儿童了。
维修费用高。智能马桶盖作为电器商品，外部电机和集成电路等具有较高的科技含量，因而后期一次性投入本钱较高。另外，超出了保修期限的智能马桶盖,一旦呈现问题则意味着消费者要停止公费修缮，假如商品需求改换中心部件，也意味着一笔不菲的收入。所以选择质保年限长和售后好的品牌同样重要，恒洁卫浴的智能马桶就推出了10年质保的承诺。
盖板不适用一切马桶。虽然马桶盖集智能、人性化、科技感、设计感于一身，但并不是一切的马桶都适用。目前主流智能马桶盖商品均面向圆弧形马桶，而与方形马桶配套的盖板稀有。其次，智能马桶盖对水箱到便座前端间隔、装置孔间间隔等具无限制，假如消费者家用的尺寸超出了所允许的区间范围，则无法顺利装置智能马桶盖，这意味着要么改换马桶、要么无法运用。所以如果马桶尺寸不符，预算充足的话还是购买一体机比较好。