1、空气供给系保养在这一方面我们要经常查看、清理空气滤清器入口、排气管出口的杂物、灰尘，确保进、排气畅通。在微耕机连续作业3-5天后必须清洗空气滤清器滤芯，若发现滤芯破损，或作业100亩（或工作100小时）应及时更换滤芯。此外对进、排气门的密封性也要定期检查。尤其是在作业400-700亩以后需要进行气门间隙的检查调整、必要时更换塞环、气门和连杆瓦。
2、燃油供给系保养在燃油供给系的保养方面，首先我们要保证油箱扣、油箱出口滤网完整无损，若发现破损及时更换，油路也要随时检查不得出现漏油现象。其次要定期进行燃油滤清器滤芯的清洗工作（工作500小时清洗一次，1000小时后进行更换）。然后作业400-700亩以后需要进行油泵、油咀压力核对，调整。最后就是微耕机的燃油一定要根据机具要求选购相应的国标汽、柴油。
3、冷却系保养这里主要分为两种，一种是风冷微耕机，该种类型的微耕机要经常检查风扇完整、无变形、进风口无杂物。一种是水冷微耕机，该种类型的微耕机应采用含钙量较小的软水（依次为：雨、雪、河、蒸馏水）以防水垢过多影响散热。此外在工作中水箱要保证有足够的冷却水，若发现缺水要渐进的加入备用水，以防加冷水过多损坏缸体。冬季作业完成后待机温降到20度时将冷却水放干，以防冻坏机体。
4、润滑系保养润滑系保养主要是润滑油的更换，微耕机在第一次使用20小时后需要更换润滑油，以后每使用100小时需更换一次。必须热机更换润滑油，秋夏季使用CC（CD）40柴机油，春、冬季使用CC（CD）30柴机油。
5、行走系保养这块的保养首先是变速箱齿轮油的更换：第一次更换是在机具使用50小时后，以后每200小时需更换一次齿轮油，也是必须热机更换，冷机更换的话则不能排尽机体内的残余机油，变速箱齿轮油必须采用国标齿轮油。其次要检查调节皮带松紧度和各螺栓的紧固情况。
6、操作系保养操作系保养主要包括三个方面，变速手柄、转向把手、离合器操纵手柄，需要保持这三项操作的灵活度。此外也要经常检查离合器分离装置，使其保持正常，否则将影响使用安全
7、作业前、后整机保养作业前应全面检查各紧固部位紧固情况，油水是否达到要求，各操作手柄是否灵活，在确认无误后方可作业。作业后要清除除外部泥土、杂草等赃物污染，机器应保管在干燥的地方，各作业机具进行防锈处理，做好与主机同处保管，以免丢失。